当法院公诉的法拍房在两次拍卖中均未能成交，即出现二次流拍的情况时，根据相关法律法规及实际操作流程，该房产通常会面临以下几种处理方式：
一、继续进行第三次拍卖
时间规定：在二次流拍后，执行法院会在六十日内组织第三次拍卖。这是法律规定的必要程序，旨在通过市场竞价机制，尽可能实现财产的最大价值。
价格调整：第三次拍卖的起拍价或保留价会根据前两次拍卖的情况进行合理调整。具体来说，第三次拍卖的起拍价将下调至第二次流拍价的80%，但每次降价幅度不得超过前次保留价的20%，以确保拍卖的公平性和吸引力。
二、抵债处理
条件：若三次拍卖均流拍，且申请执行人或其他执行债权人同意以该次拍卖所定的保留价接受拍卖财产，法院可以将其作价交予这些债权人，用以抵偿相应的债务。
执行：若债权人接受抵债，法院会办理相关手续，将房屋过户给债权人。若债权人拒绝接受，法院则需解除对房屋的查封、冻结措施，并将其退还被执行人。但需注意，被执行人仍需承担继续偿还债务的责任。
三、变卖处理
公告发布：若第三次拍卖仍然流拍，且申请执行人或其他执行债权人不同意以保留价抵债，执行法院会在第三次拍卖终结之日起七日内发出变卖公告。
变卖期限与价格：自公告之日起六十日内，法院可进行变卖。变卖价格一般与第三次拍卖的保留价相同。在此期间，任何人均可申请购买，出价达到变卖价即可成交。
后续处理：若在变卖期间内无人购买，且申请执行人、其他执行债权人仍不接受抵债，法院应解除对财产的查封、冻结措施，并将其退还被执行人。
四、其他执行措施与注意事项
其他执行措施：若房产被解除查封并退还给被执行人后，法院仍可根据具体情况采取其他执行措施，如冻结银行账户、查封其他财产等，以维护申请执行人的合法权益。
关注法院公告：对于涉及此类事务的当事人而言，建议密切关注法院的公告和通知，了解拍卖、变卖等活动的进展情况和相关规定。
核实产权与费用：在参与后续处置前，应核实房产的产权完整性，了解是否存在长期租赁、非法占用等问题。同时，明确过户税费的承担规则，避免不必要的纠纷。
防范交易风险：确认房产是否存在抵押、查封等权利限制，优先选择已完成腾退的标的物以降低收房难度。
综上所述，法拍房二次流拍后的处理方式多样且涉及多个法律程序和环节。建议当事人根据实际情况和法律规定，与法院进行沟通协商，寻求最合适的解决方案。在整个过程中，法院会严格按照法律规定和程序进行操作，确保活动的公正、公平和透明。