在人身保险中的医疗保险条款中注明适用补偿原则是合法的。以下从多个角度为你详细分析：

1. 法律依据

根据《中华人民共和国保险法》第四十六条规定：“被保险人因第三者的行为而发生死亡、伤残或者疾病等保险事故的，保险人向被保险人或者受益人给付保险金后，不享有向第三者追偿的权利，但被保险人或者受益人仍有权向第三者请求赔偿。除被保险人的家庭成员或者其组成人员故意造成本法第四十八条第一款规定的保险事故外，保险人不得对被保险人的家庭成员或者其组成人员行使代位请求赔偿的权利。但该条不适用于财产保险性质的补偿型医疗保险”。

同时，对于费用补偿型医疗保险，其设计初衷就是补偿被保险人因疾病或意外伤害导致的实际医疗费用支出。这种保险的赔付是基于被保险人实际发生的医疗费用，且赔付金额不会超过被保险人实际支出的医疗费用。因此，适用补偿原则与费用补偿型医疗保险的性质是相符的。

1. 保险原理

补偿原则是保险的基本原则之一，它要求保险人的赔偿金额不得超过被保险人的实际损失。在医疗保险中，这一原则体现在保险人只对被保险人实际发生的、合理的医疗费用进行赔付，且赔付金额不会超过被保险人实际支出的医疗费用。这有助于防止被保险人通过保险获得不当利益，维护保险市场的公平和稳定。

1. 合同约定

医疗保险条款是保险合同的重要组成部分，它明确了保险人和被保险人之间的权利和义务。如果医疗保险条款中明确注明了适用补偿原则，那么这一约定就是合法有效的。被保险人在购买医疗保险时，应当仔细阅读保险条款，了解保险产品的性质和赔付方式，以便在需要时能够获得合理的赔付。

1. 实际操作

在实际操作中，保险公司会根据医疗保险条款的约定，对被保险人提交的医疗费用进行审核和赔付。如果被保险人同时拥有多份医疗保险，且这些保险都适用补偿原则，那么被保险人无法从多份保险中获得超过其实际医疗费用的赔付。这是符合保险原理和合同约定的。