公司请年假扣绩效工资通常是不合法的。以下是对此问题的详细分析：

法律依据

1. 《职工带薪年休假条例》第二条明确规定：机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假（以下简称年休假）。单位应当保证职工享受年休假，且职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这里的“工资收入”包括基本工资、奖金、津贴以及绩效工资等各种形式的报酬。因此，绩效工资作为工资的一部分，在员工休年假时也应正常发放。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也强调：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这意味着，在员工依法享受年休假的情况下，公司无权以任何理由扣除其绩效工资。

合法与不合法情况分析

1. 合法情况（极少数）：

   • 如果单位的绩效考核周期恰好涵盖了员工休年假的时间段，且绩效确实与员工在该时间段的实际工作表现直接相关（例如，年假期间员工仍需远程处理紧急工作，且该工作对绩效有直接影响），那么单位可能会根据客观、公正的考核标准对绩效工资进行合理调整。但这种调整必须基于公平、透明的原则，并且需要有明确的考核依据，且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。不过，这种情况在实际操作中极为罕见，且需要严格的证据支持。

2. 不合法情况（常见）：

   • 大多数情况下，公司以员工休年假为由扣除绩效工资是不合法的。因为年假是法律赋予劳动者的基本权益，单位应保障员工在这些假期期间的工资待遇，包括绩效工资。如果公司无故扣除绩效工资，员工有权要求公司纠正，并可以通过沟通协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

特殊情况与应对措施

• 特殊情况：如果员工在休年假前未按照规定完成工作任务或交接，导致工作出现延误或其他问题，影响了单位的正常运作，那么单位可以根据相关规章制度和实际情况对员工的绩效进行评估和调整。但这种调整必须是基于具体的事实和规定，并且需要有明确的证据支持。同时，这种调整也不应违反《职工带薪年休假条例》和《中华人民共和国劳动合同法》的基本原则。

• 应对措施：如果公司无故扣除休年假员工的绩效工资，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

  1. 收集证据：收集好所有相关的证据，如劳动合同、绩效考核办法、年假申请记录、工资单等，以便后续维权使用。
  2. 与公司沟通：尝试与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，提出异议并要求纠正。在沟通过程中，明确表达自己的诉求和依据，并尽量保持冷静和理性。
  3. 劳动仲裁或诉讼：如果公司不改正其行为，可以向当地的劳动监察部门投诉或向劳动仲裁机构提起仲裁，要求用人单位支付被克扣的绩效工资及相应的经济补偿。在必要时，还可以向法院提起诉讼来维护自己的合法权益。

综上所述，公司请年假扣绩效工资通常是不合法的。员工应了解自己的权益，并在必要时采取合适的措施来维护自己的利益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。