在法院审理阶段发现被告人被外地公安机关取保候审的情况，可按以下方式处理：

1. 核实取保候审的合法性及有效性
   法院首先需核实外地公安机关对被告人取保候审的程序是否合法，包括取保候审的决定是否符合法定条件（如可能判处管制、拘役或独立适用附加刑，或可能判处有期徒刑以上刑罚但采取取保不致发生社会危险性等），以及是否依法送达了相关法律文书（如《取保候审决定书》《执行通知书》）。若程序合法，法院应认可该取保候审的效力；若程序违法，法院可建议外地公安机关纠正，或直接依法重新决定取保候审或变更强制措施。

2. 协调取保候审的执行与审理进程
   根据《刑事诉讼法》第71条，取保候审的执行机关为被告人居住地的派出所，若外地公安机关已指定执行地，法院需与执行地公安机关沟通，确认被告人是否遵守取保候审义务（如不得离开所居住的市县、及时到案等）。若被告人未违反规定，法院可继续审理；若被告人违反规定，法院可建议外地公安机关撤销取保候审，转为逮捕或监视居住，或直接决定逮捕。

3. 处理管辖权与强制措施的衔接
   若法院发现外地公安机关取保候审的案件不属于本院管辖（如犯罪地或被告人居住地不在本院辖区），应将案件移送有管辖权的法院，并通知外地公安机关。移送期间，被告人若需继续取保候审，由接收案件的法院与外地公安机关协商执行事宜；若需变更强制措施，由接收法院依法决定。

4. 特殊情形下的处理

   • 并案审理：若被告人涉及多个案件，部分案件已由外地公安机关取保候审，而本院需并案审理的，法院可协调外地公安机关将取保候审措施移交本院执行，或直接决定新的强制措施。
     
   • 取保候审期限届满：若取保候审期限即将届满（最长不超过12个月），法院需在期限届满前作出判决或变更强制措施；若需延长，应依法办理延长手续。
     

总结：法院在审理阶段发现被告人被外地公安机关取保候审时，应首先核实合法性，协调执行与审理进程，处理管辖权问题，并根据案件具体情况决定是否变更强制措施。若您有进一步疑问或涉及具体案件细节，可直接向我咨询，我将结合实务经验为您详细解答。