市场监管局对篡改协议行为的处理方式需结合具体违法情形确定，主要分为以下两种情况：

1. 若篡改协议行为构成合同欺诈或虚假宣传
   根据《消费者权益保护法》第五十六条，经营者存在欺诈行为的（如篡改协议内容误导消费者），市场监管部门可责令改正，并根据情节单处或并处警告、没收违法所得、处以违法所得一倍以上十倍以下罚款（无违法所得的处五十万元以下罚款）；情节严重的，责令停业整顿、吊销营业执照。
   典型场景：商家私自修改电子协议中的退款条款，拒绝履行原承诺。

2. 若篡改协议行为涉及不正当竞争或垄断协议
   根据《反不正当竞争法》第二十条，经营者通过篡改协议排除、限制竞争的（如联合其他企业固定价格、划分市场），市场监管部门可没收违法所得，并处上一年度销售额百分之一以上百分之十以下的罚款；情节严重的，吊销营业执照。
   典型场景：行业协会组织成员企业篡改合作协议，实施横向垄断行为。

补充说明：

• 市场监管部门处理时需遵循《行政处罚法》程序，包括立案、调查取证、告知陈述申辩权、作出处罚决定等环节，当事人有权申请听证或行政复议。
  
• 若篡改协议行为同时触犯《刑法》（如合同诈骗罪），市场监管部门将移送公安机关追究刑事责任，此时处罚力度会显著加重。
  

建议：若您遇到协议被篡改的情况，可先固定证据（如原始协议文本、修改记录、沟通凭证等），向当地市场监管部门举报或通过12315平台投诉，同时可依据《民法典》第四百六十九条要求对方承担违约责任。具体操作可进一步向我咨询细节。