婚后协议房子归女方并公证，这样的协议在符合法定条件的情况下是有效的。以下从多个角度为您详细分析：
一、协议有效的法律基础
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻双方可以约定婚姻关系存续期间所得的财产以及婚前财产归各自所有、共同所有或者部分各自所有、部分共同所有。这种约定应当采用书面形式，并且，如果涉及到不动产的归属，虽然公证并非协议生效的必备条件，但公证可以增强协议的证据效力，使其在法律上更具说服力。
二、协议有效的具体条件
- 双方自愿：协议必须是夫妻双方在平等、自愿的基础上签订的，任何一方不得强迫或欺骗对方签订协议。
- 内容合法：协议的内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。例如，协议中不能约定将房产归一方所有，但另一方需承担无限期的债务等不公平条款。
- 书面形式：协议应当采用书面形式，口头协议在法律上难以证明其存在和内容，因此不具备法律效力。
- 公证增强效力：虽然公证不是协议生效的必要条件，但公证可以证明协议的真实性和合法性，增强协议的证据效力。在发生纠纷时，公证过的协议更容易被法院采信。
三、协议无效或可撤销的情形
- 一方欺诈、胁迫：如果一方在签订协议时存在欺诈、胁迫等行为，导致另一方在违背真实意愿的情况下签订了协议，那么该协议可能被认定为无效或可撤销。
- 内容显失公平：如果协议的内容显失公平，例如一方承担过多义务而享受过少权利，或者另一方享受过多权利而承担过少义务，那么该协议也可能被认定为无效或可撤销。
- 违反法律、行政法规的强制性规定：如果协议的内容违反了法律、行政法规的强制性规定，那么该协议自然无效。
四、实际操作建议
- 签订书面协议：为了确保协议的法律效力，建议夫妻双方签订书面协议，并明确约定房产的归属、过户时间、违约责任等条款。
- 考虑公证：虽然公证不是必要条件，但为了增强协议的证据效力，建议夫妻双方在签订协议后进行公证。
- 咨询专业律师：在签订协议前，建议咨询专业律师，以确保协议的内容合法、有效，并符合双方的利益。
总结来说，婚后协议房子归女方并公证，在符合法定条件的情况下是有效的。但为了确保协议的法律效力，建议夫妻双方签订书面协议，并考虑进行公证。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。