关于格式条款中仲裁协议的效力认定，主要可以从以下几个方面进行分析：
仲裁协议的形式与内容要求
- 形式要求：仲裁协议必须采用书面形式，这是仲裁协议有效的基本前提。书面形式包括合同书、信件、数据电文（如电子邮件）等可以有形地表现所载内容的形式。若格式条款中的仲裁协议未以书面形式呈现，则该仲裁协议无效。
- 内容要求：仲裁协议应明确约定仲裁事项和选定的仲裁委员会。仲裁事项需具有可仲裁性，即属于法律规定可通过仲裁方式解决的纠纷范围，如合同纠纷和其他财产权益纠纷。若仲裁事项超出法律许可的仲裁范围，或仲裁委员会约定不明确且无法达成补充协议，则仲裁协议可能无效。
格式条款中仲裁协议的效力认定要点
- 主体资格：签订仲裁协议的当事人必须具有完全民事行为能力。若格式条款中的仲裁协议由无民事行为能力人或限制民事行为能力人签订，则该仲裁协议无效。
- 意思表示真实：仲裁协议必须是双方当事人真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。若格式条款中的仲裁协议存在欺诈、胁迫等导致意思表示不真实的情形，则该仲裁协议可被撤销或认定无效。
- 合法性审查：仲裁协议的内容不得违反法律、行政法规的强制性规定。若格式条款中的仲裁协议违反法律、行政法规的强制性规定，则该仲裁协议无效。
仲裁协议效力认定的机构与程序
- 认定机构：当事人对仲裁协议的效力有异议的，可以请求仲裁委员会作出决定或者请求人民法院作出裁定。若一方请求仲裁委员会作出决定，另一方请求人民法院作出裁定的，则由人民法院裁定。
- 提出异议的时限：当事人对仲裁协议的效力有异议的，应当在仲裁庭首次开庭前提出。若当事人在起诉时未声明有仲裁协议，而法院已受理，另一方在首次开庭前提交仲裁协议的，法院应当驳回起诉（除非仲裁协议无效）；若另一方在首次开庭前未提出异议，则视为放弃仲裁协议，法院将继续审理。
仲裁协议效力的法律后果
- 对当事人的效力：有效的仲裁协议排除人民法院对争议案件的管辖权。当事人达成仲裁协议后，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理，但仲裁协议无效的除外。
- 对仲裁机构的效力：有效的仲裁协议是仲裁机构行使仲裁管辖权、受理案件的唯一依据。若仲裁协议无效，则仲裁机构无权受理相关争议案件。
- 对法院的效力：对仲裁机构基于有效仲裁协议所作出的有效裁决，法院负有执行职责。若一方当事人不履行仲裁裁决，另一方当事人可以向人民法院申请执行。
举例说明：
假设某格式合同中包含一条仲裁协议，约定“因本合同产生的任何争议，均应提交至XX仲裁委员会进行仲裁”。若该仲裁协议符合上述形式与内容要求，且双方当事人均具备完全民事行为能力、意思表示真实、未违反法律强制性规定，则该仲裁协议有效。若一方当事人对仲裁协议的效力有异议，并希望向人民法院提起诉讼，则需在仲裁庭首次开庭前提出异议，并由人民法院进行裁定。若人民法院裁定仲裁协议有效，则当事人需按协议将争议提交至XX仲裁委员会进行仲裁；若人民法院裁定仲裁协议无效，则当事人可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。
特殊情况说明：
- 若格式条款中的仲裁协议涉及海事海商纠纷，则应由相应的海事法院管辖。如上述地点没有海事法院的，由就近的海事法院管辖。
- 若格式条款中的仲裁协议涉及涉外纠纷，则同样需遵循上述效力认定规则，但受理后需按照规定的程序层报最高人民法院，以确保法律适用和裁判尺度的统一。
总结与建议：
在签订包含仲裁协议的格式条款时，建议当事人仔细审查仲裁协议的形式与内容要求，确保仲裁协议的有效性。若对仲裁协议的效力存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师（即我本人，杜鹏飞律师，专注于婚姻家庭、经济纠纷、刑事辩护、交通事故、合同纠纷领域），以便获得更准确的法律意见和指导。