结论：民办非企业在理事长法人不知的情况下变更了法人，这一行为可能涉及违法变更登记，具体性质需根据变更程序是否合法、是否存在恶意串通等因素综合判断，可能构成违法行为或无效变更。

详细分析：

1. 变更登记的合法性：

   • 根据《民办非企业单位登记管理暂行条例》等相关法律法规，民办非企业单位的法人变更需遵循一定的程序，包括但不限于召开理事会或董事会形成决议、向登记管理机关提交变更申请及相关材料等。
   • 若在理事长法人不知情的情况下完成了法人变更，这很可能意味着变更程序存在瑕疵，如未召开必要的会议、未形成有效决议、未提交真实材料等，从而构成违法变更登记。

2. 恶意串通的可能性：

   • 若变更过程中存在恶意串通，如部分理事或工作人员与外部人员勾结，伪造文件、冒充签名等，以非法手段完成法人变更，则这种行为不仅违法，还可能构成犯罪，如诈骗罪、伪造公司、企业、事业单位、人民团体印章罪等。

3. 变更的效力：

   • 违法变更登记的法人变更可能被登记管理机关撤销，恢复原状。同时，相关责任人员可能面临行政处罚，如罚款、警告等。
   • 若变更行为构成犯罪，则相关责任人员还需承担刑事责任。

4. 法律建议：

   • 对于理事长法人而言，一旦发现法人被非法变更，应立即向登记管理机关报告，并申请撤销变更登记。
   • 同时，可考虑向公安机关报案，追究相关责任人员的法律责任。
   • 在此过程中，建议理事长法人咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。

后续行动建议：

• 收集证据：理事长法人应尽快收集与变更登记相关的所有文件、记录、通信等，以证明变更过程的违法性。
• 咨询律师：在采取任何行动之前，建议理事长法人咨询专业律师，了解自身权益和可能的法律途径。
• 保持沟通：与登记管理机关保持密切沟通，及时了解变更登记的撤销进展和后续处理情况。

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