监理应回复：需根据合同条款、实际损失及证据情况，综合判断赶工费索赔的合理性，并给出具体处理意见。具体分析如下：

1. 合同条款审查：

   • 首先，监理应仔细审查施工总承包合同中关于不可抗力（如特大暴雨）的条款，特别是关于工期延误、费用承担及赶工费索赔的具体规定。
   • 若合同中明确规定了因不可抗力导致的工期延误，承包单位有权提出赶工费索赔，且索赔条件、计算方式等均有明确约定，则监理应依据合同条款进行初步判断。

2. 实际损失与证据收集：

   • 监理应要求施工总承包单位提供因特大暴雨导致停止施工的具体证据，如气象部门的气象证明、现场照片、视频资料等，以证明工期延误的确实性和严重性。
   • 同时，施工总承包单位还需提供赶工方案、赶工措施费明细、人员设备增加情况等证据，以证明其为了赶工所采取的实际措施和产生的额外费用。

3. 赶工费索赔的合理性判断：

   • 监理应根据合同条款和实际损失情况，综合判断赶工费索赔的合理性。若合同中有明确规定，且施工总承包单位提供的证据充分、合理，则监理应认可其赶工费索赔的请求。
   • 若合同中未明确规定或规定不明确，或施工总承包单位提供的证据不足以证明其赶工费索赔的合理性，则监理应拒绝或部分拒绝其索赔请求，并说明理由。

4. 处理意见与沟通协调：

   • 监理应根据上述分析，给出具体的处理意见，如认可索赔金额、部分认可索赔金额或拒绝索赔等，并书面通知施工总承包单位。
   • 同时，监理应积极与建设单位沟通协调，就赶工费索赔问题达成一致意见，确保工程顺利进行。若建设单位对监理的处理意见有异议，监理应耐心解释、说明理由，并寻求双方都能接受的解决方案。

在处理此类索赔问题时，监理应保持客观、公正的态度，依据合同条款和实际损失情况，综合判断赶工费索赔的合理性，并给出具体处理意见。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，可直接向我咨询。