肇事者取得谅解支付的费用，一般不在赔偿总额中扣除，但具体情况需结合实际分析。以下从不同角度为你详细解释：
一、谅解费用的性质与目的
谅解费用，通常是在交通事故等侵权行为发生后，肇事者为了获得受害者或其家属的谅解，从而减轻或避免刑事处罚，而自愿支付的一笔费用。这笔费用往往体现了肇事者的悔过态度和对受害者或其家属的补偿意愿，但它并不属于法律规定的赔偿项目。赔偿总额则是根据法律规定，肇事者应向受害者或其家属支付的全部赔偿金额，包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等。
二、谅解费用与赔偿总额的关系
不扣除的情况：
- 在大多数情况下，谅解费用是肇事者自愿支付的，与法律规定的赔偿项目无直接关联。因此，这笔费用通常不会在赔偿总额中扣除。受害者或其家属在获得谅解费用的同时，仍然有权要求肇事者按照法律规定支付全部赔偿金额。
可能扣除的特殊情况：
- 如果双方在协商赔偿时，明确约定谅解费用作为赔偿总额的一部分，或者肇事者支付的谅解费用已经涵盖了部分或全部法律规定的赔偿项目，那么在这种情况下，谅解费用可能会在赔偿总额中相应扣除。但这种情况需要双方有明确的书面协议或约定，并且该协议或约定不违反法律法规的强制性规定。
三、法律建议
对于受害者或其家属：
- 在接受肇事者的谅解费用时，应明确该费用的性质和目的，避免与法律规定的赔偿项目混淆。
- 如果希望获得全额赔偿，应在与肇事者协商时明确说明，并保留好相关证据，以便在必要时通过法律途径维护自己的权益。
对于肇事者：
- 在支付谅解费用时，应明确该费用并不等同于法律规定的赔偿金额，避免因此产生误解或纠纷。
- 如果希望减轻或避免刑事处罚，除了支付谅解费用外，还应积极配合调查，如实陈述事实，表现出真诚的悔过态度。
四、可能的法律后果
- 如果双方对谅解费用的性质和目的存在争议，或者肇事者未按照法律规定支付赔偿金额，受害者或其家属有权通过法律途径追究肇事者的法律责任。
- 在极端情况下，如果肇事者试图通过支付谅解费用来逃避法律规定的赔偿义务，这种行为可能构成欺诈或逃避法律责任，将面临更严重的法律后果。
综上所述，肇事者取得谅解支付的费用一般不在赔偿总额中扣除，但具体情况需结合双方协商、书面协议以及法律规定来综合判断。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。