代持人已经登记为股东且不听从实际出资人意见，并不能直接认定代持合同目的不能实现，是否构成合同目的不能实现需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、代持合同的基本性质与目的
代持合同，本质上是一种委托合同关系，即实际出资人（委托人）与代持人（受托人）约定，由代持人代为持有股权，并按照实际出资人的意愿行使股东权利。代持合同的目的通常包括：
- 隐名投资：实际出资人出于各种原因（如避免关联交易、规避法律限制等）不愿直接成为公司股东，因此通过代持方式实现投资目的。
- 控制公司：实际出资人希望通过代持人控制公司，确保自己的利益在公司运营中得到保障。
二、代持人不听从意见是否构成合同目的不能实现
代持人违反合同约定：
- 如果代持合同中明确约定了代持人必须按照实际出资人的意见行使股东权利，而代持人违反了这一约定，那么实际出资人可以依据合同条款要求代持人承担违约责任。
- 在这种情况下，虽然代持人的行为可能损害了实际出资人的利益，但并不能直接认定合同目的不能实现。因为实际出资人仍然可以通过法律途径要求代持人履行合同义务或赔偿损失。
代持人行为导致合同目的无法实现：
- 如果代持人的行为（如擅自转让股权、恶意损害公司利益等）导致实际出资人无法实现其隐名投资或控制公司的目的，那么可以认为合同目的不能实现。
- 在这种情况下，实际出资人有权解除代持合同，并要求代持人承担因此造成的损失。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 如果代持人违反合同约定，实际出资人可以要求代持人继续履行合同、采取补救措施或赔偿损失。
- 如果代持人的行为导致合同目的不能实现，实际出资人有权解除合同，并要求代持人返还投资款及赔偿损失。
建议：
- 完善合同条款：在签订代持合同时，应明确约定代持人的权利义务、违约责任及合同解除条件等条款，以降低法律风险。
- 加强监督与沟通：实际出资人应加强对代持人的监督与沟通，确保代持人按照自己的意愿行使股东权利。
- 及时采取法律措施：一旦发现代持人存在违约行为或可能损害自己利益的情况，实际出资人应及时采取法律措施（如发送律师函、提起诉讼等）以维护自己的合法权益。
总结来说，代持人已经登记为股东且不听从实际出资人意见，并不能直接认定代持合同目的不能实现。是否构成合同目的不能实现需结合代持合同的具体条款、代持人的行为性质及后果等因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。