分居期间查到的对方出轨证据，在离婚纠纷中通常是有效的，但具体效力需结合证据的合法性、关联性及证明力来综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、证据的合法性

在离婚纠纷中，证据的合法性是首要考虑的因素。根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，证据必须合法取得，不能侵犯他人的合法权益，如隐私权、名誉权等。因此，如果你在分居期间通过合法手段（如公开场合的拍摄、对方自愿提供的聊天记录等）获取了对方出轨的证据，这些证据在法律上通常是有效的。

然而，如果你通过非法手段（如私自安装窃听器、偷拍他人隐私部位等）获取证据，这些证据可能因侵犯他人合法权益而被法院排除，无法作为认定事实的依据。

二、证据的关联性

证据的关联性是指证据与案件事实之间的内在联系。在离婚纠纷中，出轨证据需要与离婚原因、财产分割、子女抚养等核心问题相关联，才能发挥其证明作用。如果你查到的出轨证据能够直接证明对方在婚姻关系存续期间存在不忠行为，且该行为是导致你们感情破裂、最终分居乃至离婚的重要原因，那么这些证据在法律上将具有较高的证明力。

三、证据的证明力

证明力是指证据在证明案件事实方面所起的作用大小。出轨证据的证明力取决于其真实性、完整性和可信度。如果你查到的出轨证据真实可靠、内容完整，且能够与其他证据相互印证，形成完整的证据链，那么这些证据在法律上将具有较强的证明力。

四、分居期间的特殊情况

分居期间，虽然双方已经不在同一住所生活，但婚姻关系仍然存续。因此，分居期间查到的出轨证据，在法律上仍然属于婚姻关系存续期间的证据，可以用于证明对方在婚姻中的不忠行为。不过，需要注意的是，如果分居期间双方已经就离婚事宜达成初步协议，或者已经向法院提起离婚诉讼，那么出轨证据的收集和提交需要更加谨慎，以免因证据收集不当而影响案件的审理结果。

五、法律建议

1. 合法收集证据：在收集出轨证据时，务必遵守法律法规，不要侵犯他人的合法权益。可以通过公开场合的拍摄、对方自愿提供的聊天记录等方式合法获取证据。
2. 及时保存证据：一旦发现对方出轨，应及时保存相关证据，如聊天记录、照片、视频等。这些证据在后续的离婚纠纷中可能发挥重要作用。
3. 咨询专业律师：如果你对出轨证据的收集、保存或使用存在疑问，建议及时咨询专业律师。律师可以根据你的具体情况，为你提供专业的法律建议和指导。

分居期间查到的对方出轨证据，在离婚纠纷中通常是有效的，但具体效力需结合证据的合法性、关联性及证明力来综合判断。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。