反垄断案调查在暂停三年后继续调查，这一行为本身并不直接构成违法，但需满足一定的法律条件和程序要求。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、反垄断调查的合法性与程序要求
根据《中华人民共和国反垄断法》及相关规定，反垄断执法机构（如国家市场监督管理总局）有权对涉嫌垄断行为进行调查。调查过程中，执法机构需遵循法定程序，包括但不限于立案、调查取证、听取当事人陈述申辩、作出处理决定等。法律并未明确规定反垄断调查的期限，但要求执法机构在合理期限内完成调查，以确保行政效率与公正。
二、调查暂停与继续的合法性分析
调查暂停的合法性：
- 在调查过程中，若因特定原因（如证据不足、需要进一步收集信息、当事人申请延期等），执法机构可以决定暂停调查。暂停调查需符合法律规定，并通常需向当事人说明理由。
- 暂停调查并不意味着调查的终止，而是调查程序的一种暂时中止。在暂停期间，执法机构仍可继续收集证据、分析案情，为后续调查做准备。
继续调查的合法性：
- 当暂停调查的原因消除或达到继续调查的条件时，执法机构有权决定继续调查。继续调查需遵循法定程序，确保当事人的合法权益不受侵害。
- 继续调查本身并不因之前的暂停而违法，关键在于执法机构是否在继续调查过程中遵循了法定程序，如是否重新通知当事人、是否给予当事人陈述申辩的机会等。
三、可能存在的法律风险与合规建议
法律风险：
- 若执法机构在暂停或继续调查过程中违反法定程序，如未依法通知当事人、未给予当事人陈述申辩的机会等，可能构成程序违法，导致调查结果无效或被撤销。
- 长时间暂停调查可能引发当事人对执法机构效率的质疑，甚至可能涉及行政不作为的诉讼风险。
合规建议：
- 对于执法机构而言，应严格遵守法定程序，确保调查的合法性与公正性。在暂停或继续调查时，应及时通知当事人，并说明理由。
- 对于当事人而言，若认为执法机构的调查行为存在违法或不当之处，可以依法提出异议或申请行政复议、提起行政诉讼等，以维护自身合法权益。
四、实际案例与司法实践
- 在实际案例中，反垄断调查的暂停与继续并不罕见。关键在于执法机构是否能够依法行事，确保调查的合法性与公正性。
- 司法实践中，法院在审查反垄断调查案件时，会重点关注执法机构是否遵循了法定程序，以及调查结果是否基于充分、确凿的证据。
综上所述，反垄断案调查在暂停三年后继续调查，这一行为本身并不直接构成违法。但执法机构在暂停与继续调查过程中需严格遵守法定程序，确保调查的合法性与公正性。若您对此有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。