核心结论：若军队干部转业时部队不配合提交材料，可通过协商沟通、向上级反映、申请行政复议或提起行政诉讼等途径维权。以下是具体分析：

1. 协商沟通
   • 尝试内部沟通：首先，建议转业干部与部队负责转业工作的相关部门或具体经办人员进行友好、诚恳的沟通。明确说明自己转业手续办理的紧迫性和重要性，以及部队不配合提交材料给自己带来的困扰和影响，争取部队能够理解并积极配合提交所需材料。例如，可以以书面形式向部队相关部门提交一份详细的说明，阐述自己的情况和对提交材料的诉求。
   • 借助中间力量协调：如果直接沟通效果不佳，可以寻求部队内部其他有影响力的人员或部门的帮助，如自己的上级领导、政治部门等，请他们出面协调，促使负责提交材料的部门履行职责。
2. 向上级反映
   • 向部队上级机关反映：如果协商沟通无法解决问题，转业干部可以向部队的上级机关反映情况。可以通过正式的书面报告，详细说明部队不配合提交材料的具体事实、经过以及对自己转业安置造成的不利影响，请求上级机关责令下级部队配合提交材料。上级机关通常有监督下级部队工作的职责和权力，其介入可能会促使问题得到较快解决。
   • 向军队相关职能部门反映：除了向上级机关反映，还可以向军队中专门负责转业干部安置工作的职能部门，如军队干部转业工作办公室等反映情况。这些部门对转业工作有专业的指导和监督职责，他们可以根据具体情况进行调查核实，并协调部队配合提交材料。
3. 申请行政复议
   • 确定复议对象和事项：如果部队不配合提交材料的行为属于行政不作为，且该行为对转业干部的合法权益造成了损害，转业干部可以依法向有管辖权的行政复议机关申请行政复议。需要明确复议的对象是部队中作出不配合提交材料这一具体行政行为的部门或单位，复议的事项就是要求其履行提交材料的法定职责。
   • 准备复议材料并提交申请：准备行政复议申请书，详细陈述申请复议的事实、理由和请求，同时附上相关证据材料，如与部队沟通的记录、转业安置的相关政策文件等，证明部队不配合提交材料的事实以及自己因此受到的影响。按照规定的程序和期限向行政复议机关提交申请。
4. 提起行政诉讼
   • 判断是否符合起诉条件：如果经过行政复议后问题仍未得到解决，或者转业干部认为部队不配合提交材料的行为严重侵犯了自己的合法权益，且符合行政诉讼的起诉条件，如原告是与行政行为有利害关系的公民、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实根据等，可以向有管辖权的人民法院提起行政诉讼。
   • 准备诉讼材料并参与诉讼：准备起诉状，明确诉讼请求、事实和理由，并附上相关证据材料。在诉讼过程中，要积极配合法院的审理工作，按照法院的要求提供证据、参加庭审等，通过法律途径维护自己的合法权益。

在处理此类问题时，转业干部要注意保留好与部队沟通的记录、相关政策文件等证据材料，以便在维权过程中能够充分证明自己的主张。如果在这个过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。