公安机关窗口发现违法线索时，应依法进行登记、初步核查、移交处理，并视情况采取紧急措施，相关法律法规主要包括《公安机关办理行政案件程序规定》和《刑事诉讼法》等。具体处理流程及法律依据如下：

1. 线索登记与初步核查

   • 法律依据：根据《公安机关办理行政案件程序规定》第六十一条，公安机关窗口单位在接待群众时，发现违法线索的，应当立即进行登记，并开展初步核查工作。
   • 处理方式：窗口工作人员应详细记录线索来源、内容、涉及人员等基本信息，并通过询问、调取相关资料等方式进行初步核实，判断线索的真实性和可查性。

2. 线索移交与处理

   • 行政案件线索：若初步核查认为线索涉及行政违法行为的，窗口单位应按照管辖分工，及时将线索移交至有管辖权的公安机关内设部门（如治安、交管等）或派出所进行处理。
   • 刑事案件线索：若线索涉嫌犯罪的，窗口单位应立即按照《刑事诉讼法》的相关规定，将线索移交至刑事侦查部门，并配合开展后续侦查工作。
   • 法律依据：《公安机关办理行政案件程序规定》第六十一条第二款明确规定了线索移交的要求和程序。

3. 紧急情况下的处理

   • 紧急措施：在发现违法线索时，若情况紧急，可能对公共安全、人身安全等造成即时危害的，窗口单位工作人员有权依法采取必要的紧急措施，如制止违法行为、控制嫌疑人等。
   • 后续处理：采取紧急措施后，窗口单位应立即报告上级公安机关，并按照相关规定将案件移交至有管辖权的部门处理。

4. 保密与保护

   • 保密义务：公安机关窗口单位及其工作人员在处理违法线索过程中，应严格遵守保密规定，不得泄露线索内容及相关信息，保护举报人、证人等的合法权益。
   • 法律依据：相关法律法规对公安机关及其工作人员的保密义务有明确规定，违反者将依法承担法律责任。

总结与建议：公安机关窗口单位在发现违法线索时，应严格按照法律法规的规定进行登记、初步核查、移交处理，并在紧急情况下采取必要措施。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。