结论：针对您女儿被同学扔矿泉水瓶砸伤眼睛，导致眼睛贯穿伤的情况，赔偿问题主要涉及医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入（如果是由您或其他家庭成员护理导致的误工）。若造成残疾，还应赔偿辅助器具费和残疾赔偿金。具体赔偿金额需根据实际损失和相关证据来确定，建议通过协商、调解或诉讼等途径解决。

详细分析：

1. 赔偿范围：

   • 医疗费：包括因治疗眼睛贯穿伤所产生的所有合理医疗费用，如手术费、药费、检查费等。
   • 护理费：如果女儿在治疗和康复期间需要专人护理，那么护理人员的费用也应纳入赔偿范围。
   • 交通费：因就医或转院治疗所产生的交通费用。
   • 营养费：根据女儿的伤情和医生的建议，可能需要额外的营养支持，这部分费用也应考虑在内。
   • 住院伙食补助费：如果女儿需要住院治疗，那么住院期间的伙食补助费也应由侵权方承担。
   • 误工费：如果是由您或其他家庭成员护理女儿，导致无法正常工作而减少的收入，也应纳入赔偿范围。
   • 残疾赔偿金：如果女儿的眼睛贯穿伤导致了残疾，那么根据残疾等级，侵权方还应支付残疾赔偿金。

2. 赔偿责任的确定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。在此情况下，扔矿泉水瓶的同学显然存在过错，因此应承担赔偿责任。
   • 如果该同学是未成年人，那么其监护人应承担相应的赔偿责任。

3. 赔偿途径：

   • 协商：您可以首先尝试与侵权方或其监护人进行协商，看是否能就赔偿金额和方式达成一致。
   • 调解：如果协商无果，您可以寻求学校、社区或相关调解机构的帮助，进行调解。
   • 诉讼：如果调解也无果，您可以向法院提起诉讼，要求侵权方或其监护人承担赔偿责任。

4. 证据收集：

   • 在处理此类赔偿问题时，证据的收集至关重要。您应保留所有与治疗和康复相关的医疗记录、费用单据、交通费用单据等，以便在协商、调解或诉讼过程中证明您的实际损失。
   • 同时，如果有目击者或监控录像等能够证明侵权行为的证据，也应一并收集并保留。

建议：

• 在处理此类赔偿问题时，建议您保持冷静和理性，通过合法途径来维护您和女儿的权益。
• 如果对赔偿金额或赔偿途径有疑问或不确定的地方，您可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况和相关法律法规给出更具体的建议。
• 请注意，赔偿问题可能涉及复杂的法律程序和证据收集工作，因此建议您在处理过程中保持耐心和细心，确保每一步都符合法律规定和程序要求。