结论前置：公司开除员工时，必须依据《工资支付暂行规定》第九条，在劳动合同解除或终止时一次性结清员工的工资。这是法律规定的强制性义务，无论解除劳动合同的情形如何，公司都应严格遵守。
一、法律依据与基本规定
根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这一规定是保障劳动者合法权益的重要法律条款，任何用人单位都必须严格遵守，不得以任何理由拒绝或拖延支付。
二、不同解除情形下的工资结清义务
合法解除且无赔偿情形
- 当员工存在严重违反公司规章制度、严重失职给公司造成重大损害等符合《劳动合同法》相关规定的情形时，公司可以合法解除劳动合同且无需支付经济补偿。但即便如此，公司仍需在解除劳动合同时结清员工的工资。
- 举例：若员工因多次擅自离岗被公司开除，公司应在其离职时一次性支付其已工作期间的工资。
合法解除需支付经济补偿情形
- 在某些合法解除劳动合同的情形下，如公司因经营困难进行裁员等，除了结清员工工资外，还需按照法律规定支付经济补偿。经济补偿的计算方式为：按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
- 举例：若员工在公司工作了3年，月工资为5000元，因公司经营困难被裁员，公司除需结清其当月工资外，还需支付其3个月工资的经济补偿，即15000元。
违法解除情形
- 若公司违反《劳动合同法》的规定解除劳动合同，员工有权要求公司继续履行劳动合同，或者要求公司按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。同时，公司也必须结清员工的工资。
- 举例：若公司无正当理由突然开除员工，且员工不要求继续履行合同，则公司除需立即结清员工的工资外，还需按照经济补偿计算方式的二倍支付赔偿金。
三、未按时支付工资的法律后果及应对措施
- 法律后果：如果用人单位未能按时支付工资，将构成违法行为，需承担相应的法律责任。
- 劳动者权益保护：
- 协商：劳动者首先可与用人单位协商，要求其及时支付工资。
- 投诉：若协商无果，劳动者可向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权责令用人单位限期支付工资；逾期不支付的，还将责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
- 申请支付令：劳动者还可以依法向当地人民法院申请支付令，人民法院应当依法发出支付令，要求用人单位支付拖欠的工资。
- 劳动仲裁：如问题仍无法解决，劳动者可申请劳动仲裁，通过仲裁机构裁决来维护自己的合法权益，包括要求用人单位支付工资及可能的经济补偿等。
四、实际操作建议
为避免纠纷，劳动者在就业期间应妥善保存劳动合同、工作证、考勤记录等能证明劳动关系和劳动时间的证据。这些证据在发生争议时将起到关键作用，有助于劳动者维护自己的合法权益。同时，劳动者在离职时也应要求公司出具离职证明，并确认工资已结清，以避免后续纠纷。
综上所述，公司在开除员工时必须严格按照法律规定及时清算并一次性付清工资，同时办理好相关手续。这是法律的要求，也是维护企业良好形象和避免不必要法律纠纷的重要举措。劳动者也应了解自己的权益，并在必要时采取合适的措施来保护自己。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。