侵占罪起诉与清算能否一起处理，需分情况讨论，结论如下：

1. 侵占罪与清算程序分属不同法律体系，一般不直接合并处理
   侵占罪属于刑事犯罪，依据《刑法》第二百七十条，需由公安机关立案侦查、检察院提起公诉，最终由法院刑事审判庭判决。而清算程序（如公司清算、破产清算）属于民事或商事范畴，由法院民事审判庭或破产审判庭主导，目的是清理债权债务、分配剩余财产。两者性质、程序、法律后果均不同，通常不会在同一案件中直接合并处理。

2. 特殊情况下，清算程序可能触发侵占罪刑事追责
   若在清算过程中发现公司董事、高管或实际控制人存在侵占公司财产的行为（如虚构债务、转移资产、私分财产等），清算组或债权人可向公安机关报案，启动刑事追责程序。此时，侵占罪的刑事诉讼与清算程序会并行推进，但处理方式不同：

   • 刑事部分：公安机关侦查、检察院起诉、法院判决，追究行为人刑事责任（如有期徒刑、罚金）；
     
   • 民事部分：清算程序继续进行，通过追回被侵占财产、确认债权债务等方式保障债权人利益。
     关键点：刑事判决结果可能影响民事清算中财产分配的公平性，但两者仍属独立程序，法院会分别审理。

3. “一起判”的误解需澄清
   用户可能误以为“一起判”是指同一法院、同一判决中同时处理刑事和民事问题。实际上，根据“先刑后民”原则（若刑事案件结果影响民事案件），法院可能中止清算程序，待刑事判决生效后恢复；或刑事、民事案件分别审理，最终在执行阶段协调财产分配。但无论如何，不会在同一判决中同时宣告刑事责任和清算结果。

法律建议：

• 若您是清算程序中的债权人或清算组成员，发现侵占行为，应立即向公安机关报案，同时推进清算程序，保留相关证据（如财务记录、转账凭证等）；
  
• 若您是涉嫌侵占罪的当事人，需同时应对刑事侦查和清算程序中的财产追索，建议委托律师同步处理刑事辩护和民事争议，避免程序冲突或证据矛盾。
  

如有具体案情，可进一步向我咨询，我会结合细节提供更精准的分析。