在申请劳动仲裁时，赔偿金的计算确实是一个涉及多种情形且每种情形的计算方式及法律依据都各不相同的问题。下面我将为您详细整合与分析各类赔偿金的计算方式，希望能为您提供全面、准确且条理清晰的法律指导。
一、违法解除或终止劳动合同的赔偿金
法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条，如果用人单位违反法律规定解除或终止劳动合同，那么它需要按照经济补偿标准的二倍来支付赔偿金。
计算方式：
经济补偿标准：这主要依据劳动者在本单位的工作年限来确定。每满一年，用人单位需要支付一个月的工资作为补偿；如果工作六个月以上但不满一年，也按一年来计算；如果工作不满六个月，则支付半个月的工资。这里的月工资，是指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
赔偿金数额：将上述计算出的经济补偿标准乘以二，即可得到赔偿金的具体数额。
举例：假设劳动者在某单位工作了3年，月工资为5000元，那么他的赔偿金就是3年×5000元/年×2=30000元。
二、未签订书面劳动合同的二倍工资差额
法律依据：依据《中华人民共和国劳动合同法》第八十二条，如果用人单位自用工之日起超过一个月但不满一年未与劳动者签订书面劳动合同，或者违反规定不订立无固定期限劳动合同，那么它需要每月支付二倍的工资。
计算方式：
一般情形：从用工的第二个月起，直到补签合同的前一日，或者用工满一年的前一日，用人单位需要按月支付二倍的工资差额。这个差额就是劳动者应得的工资乘以未签合同的月数再减一（因为第一个月不需要支付二倍工资）。
特殊情形：如果应该订立无固定期限劳动合同但未订立，那么从应该订立的那一天起，直到解除劳动关系的那一天止，用人单位都需要每月支付二倍的工资。
举例：如果劳动者入职后11个月都未签合同，月工资为6000元，那么他的二倍工资差额就是6000元×（10个月-1个月）=54000元。
三、拖欠工资的赔偿金
法律依据：根据《劳动合同法》第八十五条，如果用人单位没有按照约定或者国家规定及时足额支付工资，并且经过劳动行政部门责令限期支付后仍然逾期不支付，那么它需要按照应付金额的百分之五十至百分之一百的标准来加付赔偿金。
计算方式：赔偿金=拖欠的工资数额×（50%-100%），具体比例由劳动行政部门来确定。
四、加班费的赔偿金
法律依据：同样依据《劳动合同法》第八十五条，如果用人单位安排加班但不支付加班费，那么它也需要按照应付金额的百分之五十至百分之一百来加付赔偿金。
计算方式：
确定加班费：平时加班的话，加班费不低于工资的150%；休息日加班且不能补休的话，加班费为工资的200%；法定休假日加班的话，加班费为工资的300%。
计算赔偿金：赔偿金=应付的加班费×（50%-100%），具体比例同样由劳动行政部门来确定。
五、其他重要注意事项
仲裁时效：根据《劳动争议调解仲裁法》，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起开始计算。在特定情形下，这个时效可以中断或者中止。
举证责任：在劳动仲裁中，遵循“谁主张，谁举证”的原则。也就是说，劳动者需要对自己提出的主张提供证据来支持。
强制执行：如果用人单位拒不履行仲裁裁决，那么劳动者可以在规定的期限内向人民法院申请强制执行。
综上所述，申请劳动仲裁时赔偿金的计算确实需要根据具体情况和法律规定来确定。因此，在申请仲裁前，我建议您仔细收集并整理相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以支持自己的主张。同时，了解并掌握仲裁时效、举证责任及强制执行等法律规定，对于维护自身合法权益也是至关重要的。如果您在必要时，也可以咨询专业律师或相关机构以获取更全面的法律帮助。