结论：机构发论文没发出来退款是否算诈骗，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。

1. 若机构存在虚构事实、隐瞒真相等行为：

• 法律分析：诈骗罪是指以非法占有为目的，使用欺骗方法，骗取数额较大的公私财物的行为。如果机构在收取费用时，就明知自己无法完成论文发表任务，却虚构事实、隐瞒真相，比如声称有特殊的发表渠道、与某期刊有合作关系等，以此骗取用户的信任并收取费用，之后又未能发表且拒绝退款，那么这种行为就可能构成诈骗。
• 举例说明：比如，某机构声称与某核心期刊有独家合作关系，可以确保论文在该期刊上发表，并以此收取高额费用。但实际上，该机构与该期刊并无任何合作关系，也无法保证论文发表。用户支付费用后，论文未能发表，且机构拒绝退款。这种情况下，机构的行为就可能构成诈骗。

2. 若机构因客观原因未能发表且愿意退款：

• 法律分析：如果机构在收取费用时，是出于真实意愿想要帮助用户发表论文，但由于客观原因（如期刊审稿周期长、论文质量不符合要求等）导致未能发表，且机构愿意按照约定或合理方式退款，那么这种行为就不构成诈骗。这更可能是一种合同纠纷或服务未达预期的情况。
• 举例说明：比如，某机构与用户约定，在一定期限内帮助用户将论文发表在某期刊上，并收取了相应费用。但由于期刊审稿周期较长，或者用户论文质量需要进一步修改，导致在约定期限内未能发表。机构在了解情况后，主动与用户沟通，并按照约定或合理方式退还了部分或全部费用。这种情况下，机构的行为就不构成诈骗。

3. 若机构存在部分履行或不当履行的情况：

• 法律分析：如果机构在收取费用后，部分履行了合同义务（如进行了论文修改、提交了审稿申请等），但由于自身原因（如能力不足、疏忽大意等）导致未能完全履行合同义务（即论文未能发表），且机构在退款问题上存在拖延、拒绝等不当行为，那么这种情况可能不构成诈骗，但可能构成违约或不当得利。用户可以根据合同约定或相关法律规定，要求机构承担违约责任或返还不当得利。
• 举例说明：比如，某机构收取费用后，对用户的论文进行了修改，并提交给了某期刊进行审稿。但由于机构修改不当或提交材料不全等原因，导致论文未能通过审稿。机构在了解情况后，虽然表示愿意退款，但一直拖延不付。这种情况下，机构的行为可能不构成诈骗，但用户可以依据合同约定或相关法律规定，要求机构承担违约责任或返还已支付的费用。

建议：如果您遇到了类似情况，建议您先与机构进行沟通协商，了解未能发表的具体原因和退款政策。如果机构拒绝退款或存在其他不当行为，您可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。如有需要，可以直接向我咨询相关法律问题。