在交通肇事罪案件中，若检察院作出不起诉决定后，公安机关一般会终止对案件的侦查，但根据不同情况，公安机关也可能采取其他处理措施。具体如下：

1. 法定不起诉情形下的处理
   根据《刑事诉讼法》第177条，若检察院认为犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或符合《刑事诉讼法》第16条规定的情形（如情节显著轻微、已过追诉时效等），会作出法定不起诉决定。此时，公安机关需立即释放被羁押的犯罪嫌疑人，并撤销案件，终止所有侦查活动。例如，若事故仅因意外因素导致且无证据证明驾驶人存在过失，公安机关将依法结案。

2. 酌定不起诉情形下的处理
   若犯罪情节轻微（如轻微超速、未造成严重后果），且犯罪嫌疑人认罪认罚、积极赔偿并取得谅解，检察院可能作出酌定不起诉决定。此时，公安机关虽已移送审查起诉，但侦查程序已终结，无需进一步行动。不过，若公安机关认为不起诉决定有误，可依据《人民检察院刑事诉讼规则》第557条，在收到决定书后7日内要求复议；若意见未被采纳，还可在复议决定作出后7日内提请复核，但复议复核期间不影响不起诉决定的效力。

3. 证据不足不起诉（存疑不起诉）情形下的处理
   若检察院认为案件证据不足，不符合起诉条件，会作出存疑不起诉决定。此时，公安机关若发现新证据，可依据《刑事诉讼法》第175条重新启动侦查程序。例如，若后续调取到关键监控录像或证人证言，证明驾驶人存在重大过失，公安机关可重新立案侦查，并将新证据移送检察院审查起诉。

总结与建议：
检察院不起诉决定生效后，公安机关的处理方式取决于不起诉类型。若您或他人涉及此类案件，建议结合具体情节（如事故责任认定、赔偿情况、证据充分性等）进一步分析。如有疑问，可直接向我咨询，我将结合实务经验为您提供详细解答。