结论：替别人担保农民工工资被扣的钱能否取出来，需视具体情况而定，包括担保的性质、是否已履行担保责任、是否存在追偿权以及是否涉及法律程序等。以下从不同角度进行分析：
一、担保性质与责任承担
一般保证与连带责任保证：
- 若您提供的是一般保证，根据《民法典》的相关规定，您享有先诉抗辩权，即在主合同纠纷未经审判或仲裁，并就债务人财产依法强制执行仍不能履行债务前，您有权拒绝向债权人承担保证责任。在此情况下，若农民工工资被扣并非因您直接承担保证责任所致，而是因债务人未履行债务，且债权人已通过法律程序向债务人追偿，那么您被扣的钱在符合一定条件下（如债务人财产不足以清偿债务，且您已承担保证责任）可能有机会通过法律途径追回。
- 若您提供的是连带责任保证，则您与债务人对债务承担连带责任。债权人可以直接要求您承担保证责任，包括支付农民工工资。在此情况下，若您已实际支付了工资，且该支付行为符合担保合同的约定和法律规定，那么您有权向债务人追偿。若债务人拒绝偿还，您可以通过法律途径（如起诉）来维护自己的权益。
担保合同的具体约定：
- 担保合同中可能对担保人的责任范围、追偿权等事项有具体约定。若合同中有明确约定您在承担担保责任后有权向债务人追偿，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么您被扣的钱在符合合同约定的情况下可以通过追偿来取回。
二、法律程序与追偿权
追偿权的行使：
- 若您已实际承担了担保责任（如支付了农民工工资），且根据担保合同或法律规定享有追偿权，那么您可以向债务人行使追偿权。在行使追偿权时，您需要提供证据证明自己已实际承担了担保责任，且该责任应由债务人承担。
法律程序的选择：
- 若您与债务人之间无法就追偿事宜达成一致，您可以通过法律途径（如起诉）来维护自己的权益。在起诉过程中，您需要提交相关证据（如担保合同、支付凭证等）来证明自己的主张。若法院判决支持您的诉求，那么您被扣的钱将有机会通过执行程序来取回。
三、特殊情况与注意事项
担保人过错：
- 若因您的过错（如未尽到审查义务、未及时通知债务人等）导致债权人扣除了您的钱，那么您可能难以通过追偿来取回全部或部分钱款。在此情况下，您可能需要承担一定的法律责任。
法律时效：
- 追偿权的行使可能受到法律时效的限制。根据《民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。因此，您需要在法定期限内行使追偿权，以免丧失法律保护。
建议：若您因替别人担保农民工工资而被扣了钱，建议您首先审查担保合同的约定和法律规定，确定自己是否享有追偿权。若享有追偿权，您可以尝试与债务人协商解决；若协商无果，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。在此过程中，建议您咨询专业律师的意见，以便更好地了解自己的法律地位和权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。