结论：要追回因担保而被银行扣除的1000元，需先明确担保的具体情况、银行扣款的原因及依据，再根据实际情况采取相应的法律措施。以下是对此问题的详细分析：

一、明确担保情况

1. 担保类型：首先，需要明确你提供的是何种类型的担保（如保证、抵押、质押等），以及担保的具体范围和期限。这有助于确定你的法律责任和追回款项的可能性。

2. 担保合同：审查你与银行签订的担保合同，了解合同中关于担保责任、扣款条件、追偿权等条款的具体约定。这是后续维权的重要依据。

二、分析银行扣款原因及依据

1. 扣款原因：银行扣款通常是因为借款人未能按时还款或违反了贷款合同的其他约定。你需要了解借款人具体的违约情况，以及这是否触发了担保合同中的扣款条款。

2. 扣款依据：银行扣款应有明确的法律依据和合同依据。你可以要求银行提供扣款的具体依据，包括贷款合同、担保合同以及相关的法律法规。

三、采取法律措施追回款项

1. 与银行协商：

   • 在了解扣款原因和依据后，你可以首先尝试与银行进行协商，说明你的立场和理由，要求银行退还扣除的款项。
   • 如果银行同意退还，应要求银行出具书面确认，并明确退还款项的时间和方式。

2. 向借款人追偿：

   • 如果银行扣款是因为借款人违约，且你作为担保人已经承担了担保责任，那么你有权向借款人追偿。
   • 你可以通过与借款人协商、发送律师函或提起诉讼等方式来追偿。在追偿过程中，你需要提供充分的证据证明你的担保责任和已经承担的损失。

3. 法律途径维权：

   • 如果银行扣款没有合法依据或违反了合同约定，你可以考虑通过法律途径来维权。
   • 你可以向当地银保监会或相关监管部门投诉银行的违规行为，或者向法院提起诉讼要求银行退还扣除的款项并赔偿损失。

四、注意事项

1. 保留证据：在整个过程中，你需要保留好所有与担保、扣款相关的证据，包括担保合同、贷款合同、扣款通知、协商记录等。这些证据将是你维权的重要依据。

2. 及时行动：一旦发现银行扣款有误或没有合法依据，你应及时采取行动来维权。拖延时间可能会导致证据丢失或维权难度增加。

3. 咨询专业意见：如果你对担保法律或银行扣款流程不熟悉，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据你的具体情况提供针对性的法律建议和维权方案。

后续建议：如果你在处理此事过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供进一步的法律帮助和建议。