针对您提出的“申请强制执行的期限超过后怎么办”的问题，这确实是一个涉及法律程序和权益保护的重要问题。下面我将根据不同情况，为您详细解答。
一、民事强制执行超过时限的情况
在民事强制执行中，若超过了法律规定的二年申请执行期限，处理方式需根据被执行人是否提出时效抗辩来定：
未提出时效抗辩：
- 如果被执行人没有对申请执行时效期间提出异议，人民法院将不会主动审查申请执行时效问题，而是会依法受理执行申请，并按照法定程序执行。这意味着，即便超过了二年的申请执行期限，只要被执行人未提出时效抗辩，执行程序仍将继续进行。
提出时效抗辩且异议成立：
- 若被执行人以申请执行时效期间届满为由提出异议，并且人民法院经审查认为异议成立，那么法院将会裁定不予执行。此时，申请执行人仍有多种途径可以救济自己的权利：
- 与被执行人达成和解：双方可以就债务履行重新协商并达成和解协议，明确还款的方式、时间、金额等具体内容。一旦和解协议达成，被执行人应按照协议内容履行义务。如果被执行人不履行和解协议，申请执行人有权向执行法院提起诉讼，要求履行该和解协议。
- 寻找诉讼时效中止、中断的证据：申请执行人可以积极寻找并提供导致时效中止或中断的证据。例如，在申请执行时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或其他障碍导致无法行使请求权，可以申请时效中止。同样，如果申请执行人在时效期间内向被执行人提出了履行要求，或者双方达成了和解协议，或者被执行人同意履行义务，都可以导致时效中断。找到这些证据并向法院提供，经法院审查认可后，仍有可能受理强制执行申请。
二、行政强制执行超过申请期限的情况
对于行政强制执行，若超过了法定的申请期限（通常为自期限届满之日起三个月内），行政机关原则上不能再向人民法院申请强制执行。但行政机关和当事人可以采取以下措施：
行政机关：
- 与当事人协商：尝试与当事人进行沟通协商，通过友好方式促使当事人自觉履行行政决定。
- 分析未及时申请原因，寻求补救：如果因不可抗力或其他不属于行政机关自身的原因导致申请期限延误，行政机关应在障碍消除后的一定期限内，向法院说明情况并提供相关证明材料，申请延长期限。
当事人：
- 积极应对行政机关后续措施：当行政机关提出协商履行行政决定时，当事人应积极回应，根据自身实际情况探讨可行的履行方案。
- 维护自身合法权益：若行政机关采取不合理方式强制要求履行义务，当事人有权拒绝，并通过合法途径维权，如向行政机关的上级主管部门申诉，或依法提起行政复议、行政诉讼。
三、一般应对步骤
无论哪种情况，面对强制执行超过时限的问题，申请执行人或当事人都可以采取以下一般步骤：
- 明确法律规定：仔细查阅相关的法律条文或咨询当地的法律专业人士，以确保对强制执行的具体时限规定有准确的理解。
- 与执行法院或相关机关沟通：详细说明情况，要求解释为什么执行会超过时限，并要求他们尽快采取措施来纠正这个问题。
- 向上级机构申诉或投诉：如果法院或相关机关未能给出合理的解释或未及时采取行动，可以考虑向上级法院或其他相关机构提出申诉或投诉。
- 寻求法律援助或专业律师帮助：专业的律师可以帮助评估情况，提供法律建议，并代表与法院或其他相关机构进行沟通，以更有效地解决问题。
综上所述，面对强制执行超过时限的情况，申请执行人或当事人应积极采取行动来保护自己的合法权益。通过了解法律规定、与相关机关沟通、向上级机构申诉以及寻求专业帮助等途径，可以更有效地解决这个问题。希望这些解答能对您有所帮助。