在贷款90天以上逾期的情况下，本金和利息的偿还顺序通常遵循以下规则：

1. 合同约定优先：首先，应查看贷款合同中是否有关于逾期还款时本金和利息偿还顺序的明确约定。如果合同中有相关规定，那么双方应按照合同约定执行。这是基于合同自由原则，即合同双方有权在法律允许的范围内自由约定合同条款。

2. 法定顺序：如果贷款合同中没有明确约定逾期还款时本金和利息的偿还顺序，那么根据一般的法律原则和实务操作，通常会先偿还逾期利息（包括罚息和复利），再偿还本金。这是因为利息是借款人因使用贷款资金而应支付给贷款人的报酬，逾期利息则是对借款人逾期还款行为的一种惩罚性措施。在借款人逾期还款的情况下，贷款人首先有权要求借款人支付逾期利息，以弥补其因借款人违约而遭受的损失。在支付完逾期利息后，剩余的款项再用于偿还本金。

3. 特殊情况：当然，也存在一些特殊情况。例如，如果贷款合同中明确约定了逾期还款时先偿还本金再偿还利息，或者双方在逾期后达成了新的还款协议并明确了偿还顺序，那么应按照这些约定或协议执行。此外，如果贷款人出于某种原因（如催收策略、风险控制等）同意借款人先偿还本金再偿还利息，这也是可以的，但需要双方达成一致意见并签订书面协议。

建议：对于借款人而言，在贷款逾期后，应尽快与贷款人沟通并协商还款计划，以避免逾期利息的不断累积和可能产生的法律风险。同时，借款人也应仔细阅读贷款合同中的相关条款，了解自己的权利和义务。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。