结论：事业单位下属机构与业主签署的拆迁补偿协议，其效力及是否属于行政协议，需根据具体情况判断。一般来说，若该下属机构受事业单位委托，且拆迁行为属于行政行为范畴，则该协议可能被视为行政协议，具有行政法上的效力；若拆迁行为属于民事行为范畴，则该协议为民事合同，具有民法上的效力。以下是对此问题的详细分析：
一、协议效力的判断
主体资格：
- 事业单位下属机构若具备独立的法人资格或经事业单位明确授权，且该授权在法律允许的范围内，则其签署的拆迁补偿协议在主体上是有效的。
- 若下属机构不具备独立法人资格且未经事业单位明确授权，或授权超出法律允许的范围，则其签署的协议可能因主体不适格而无效。
行为性质：
- 拆迁行为若属于行政机关行使行政职权、进行行政管理的范畴，如因公共利益需要进行的拆迁，则下属机构签署的协议可能被视为行政协议，受行政法调整。
- 若拆迁行为属于民事主体之间的平等交易，如商业开发导致的拆迁，则下属机构签署的协议为民事合同，受民法调整。
协议内容：
- 协议内容需符合法律法规的规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定，否则协议可能因内容违法而无效。
- 协议内容还需公平、合理，不得显失公平或存在欺诈、胁迫等情形，否则可能影响协议的效力。
二、是否属于行政协议的判断
行政协议的定义：
- 行政协议是指行政机关与公民、法人或其他组织之间，为实现行政管理目标、履行行政职责而订立的协议。
判断标准：
- 主体标准：协议一方是否为行政机关或受行政机关委托的组织。在此情况下，若事业单位下属机构受事业单位委托进行拆迁，且事业单位本身具有行政管理职能，则该下属机构签署的协议可能被视为行政协议。
- 目的标准：协议是否为实现行政管理目标、履行行政职责。若拆迁行为是为了公共利益需要，如城市规划、基础设施建设等，则该协议可能被视为行政协议。
- 内容标准：协议内容是否涉及行政职权的行使。若协议中涉及行政机关对拆迁补偿标准、拆迁程序等的决定或审批，则该协议可能被视为行政协议。
三、法律建议
对于业主：
- 在签署拆迁补偿协议前，应仔细审查协议内容，确保协议内容合法、公平、合理。
- 若对协议效力或性质有疑问，可咨询专业律师或相关行政机关，以获取准确的法律意见。
对于事业单位下属机构：
- 在签署拆迁补偿协议前，应确保自身具备签署协议的主体资格，且拆迁行为符合法律法规的规定。
- 若拆迁行为属于行政行为范畴，应严格按照行政程序进行，确保协议的合法性和有效性。
争议解决：
- 若因拆迁补偿协议产生争议，双方可首先通过协商、调解等方式解决。
- 若协商、调解无果，可依法向人民法院提起诉讼或申请仲裁，以维护自身合法权益。
若您在拆迁补偿协议方面遇到任何法律问题，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。