在通过产权交易所挂牌交易的合同纠纷中，是否可以将交易所列为被告，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、交易所作为合同一方的情况
如果交易所不仅仅是提供一个交易平台，而是直接参与了合同的签订或履行，例如作为买卖合同的一方，或者作为中介服务合同中明确承担特定责任的一方，那么在发生合同纠纷时，交易所就可能成为被告。这是因为，根据合同法的相关规定，合同当事人应当按照约定履行自己的义务，如果一方不履行或者履行不符合约定，就应当承担违约责任。因此，在这种情况下，交易所作为合同的一方，如果存在违约行为，自然可以被列为被告。
二、交易所仅作为交易平台的情况
交易所无过错时：如果交易所仅仅是提供了一个交易平台，对于交易双方的具体交易内容、交易方式等并不直接参与，且已经尽到了合理的审查义务和管理责任，那么在发生合同纠纷时，交易所通常不会被列为被告。因为交易所并没有直接参与到合同中，也没有违反任何合同义务或法律规定。
交易所存在过错时：然而，如果交易所在提供交易平台的过程中存在过错，例如未对交易双方进行必要的资质审查、未对交易信息进行及时准确的披露、未对交易过程进行必要的监管等，导致交易双方因此遭受损失，那么交易所就可能因为其过错行为而被列为共同被告或第三人。在这种情况下，交易所需要承担与其过错相适应的法律责任。
三、法律建议
审查合同条款：在发生合同纠纷时，首先应当仔细审查合同条款，明确合同各方的权利和义务，以及交易所的具体角色和责任。这有助于判断交易所是否应当被列为被告。
收集证据：如果认为交易所存在过错行为，应当积极收集相关证据，例如交易所的审查记录、信息披露情况、监管记录等。这些证据将有助于证明交易所的过错行为以及其与损失之间的因果关系。
咨询专业律师：由于合同纠纷往往涉及复杂的法律问题和事实认定，因此建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据具体情况分析交易所的法律责任，并帮助制定合适的诉讼策略。
总结来说，在通过产权交易所挂牌交易的合同纠纷中，是否可以将交易所列为被告取决于交易所的具体角色和责任。如果交易所直接参与了合同签订或履行且存在违约行为，或者作为交易平台存在过错行为导致交易双方遭受损失，那么交易所就可能被列为被告。因此，在处理此类纠纷时，应当仔细审查合同条款、收集相关证据，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。