结论：在补充协议中条款写到的“本合同”，通常指的是主合同，但具体还需结合补充协议的上下文及双方的真实意图来确定。
分析说明：
通常理解：
- 在合同法律实践中，当补充协议作为合同附件存在时，补充协议中的“本合同”一词，一般会被理解为指代主合同。这是因为补充协议的目的是对主合同的某些条款进行补充、修改或细化，而非创建一个全新的合同关系。因此，从逻辑和常规理解上，“本合同”应指向被补充的主合同。
结合上下文判断：
- 然而，法律问题的解答不能仅凭常规理解，还需结合补充协议的具体上下文来判断。如果补充协议中明确指出了“本合同”的具体含义，或者通过上下文可以清晰推断出“本合同”指的是主合同还是补充协议本身（尽管这种情况较为罕见），那么应遵循该具体指示或推断。
双方真实意图：
- 在合同解释中，双方的真实意图是至关重要的。如果补充协议中的“本合同”一词存在歧义，或者双方对其理解存在争议，那么应通过考察双方签订补充协议时的背景、目的、交易习惯等因素，来推断双方的真实意图。
法律建议：
- 明确约定：为了避免未来可能出现的争议，建议在补充协议中明确约定“本合同”的具体含义，即指代主合同还是补充协议本身（尽管后者较为罕见）。
- 审查上下文：在签订补充协议时，务必仔细审查其上下文，确保“本合同”一词的使用不会引发歧义或误解。
- 咨询专业律师：如果对于补充协议中的“本合同”一词存在疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以便获得准确的法律意见和解决方案。
可能后果：
- 如果补充协议中的“本合同”一词理解错误，可能会导致合同条款的解释出现偏差，进而影响双方的权利和义务。在极端情况下，甚至可能引发合同纠纷或诉讼。因此，务必确保对“本合同”一词的理解准确无误。
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