是的，“主协议之补充协议”通常指的就是主协议的补充协议。下面我将从几个角度详细解释这一概念：
一、定义与关系
定义：
- 主协议：是双方当事人就某一事项达成的初步协议，它规定了双方的基本权利和义务。
- 补充协议：是对主协议中没有约定或者约定不明确事项的补充。当主协议中的某些内容存在漏洞或不明确时，双方可以通过签订补充协议来完善主协议。
关系：
- 补充协议是相对于主协议而言的，它是对主协议的补充和完善。
- 主协议与补充协议之间存在主从关系，即主协议是主要的、基础的协议，而补充协议则是辅助的、补充性的协议。
二、法律背景与依据
- 根据《民法典》的相关规定，合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。这为补充协议的存在提供了法律依据。
三、补充协议的内容与效力
内容：
- 补充协议的内容应当是主合同的非主要内容，也可以说是非主要条款。它主要用于补充主协议中未约定或约定不明确的事项。
- 如果主协议的主要条款没有约定或者约定不明确，导致主协议不成立也不生效，那么此时无法签订补充协议。因为补充协议的前提是主协议已经存在且部分内容需要补充。
效力：
- 补充协议一旦签订，即具有法律效力，对双方当事人产生约束力。
- 补充协议与主协议具有同等的法律效力，但在内容上不得与主协议相抵触。如果补充协议与主协议存在冲突，应以补充协议为准（当然，这也要看具体条款的约定和法律的规定）。
四、实际应用与建议
实际应用：
- 在实际交易中，双方当事人可能会因为各种原因在签订主协议后发现某些内容需要补充或修改。此时，他们可以通过签订补充协议来完善主协议。
- 补充协议可以涉及多个方面，如价格调整、履行期限变更、违约责任等。
建议：
- 在签订补充协议时，双方当事人应明确补充协议的内容、目的和效力，确保补充协议与主协议的一致性和协调性。
- 同时，双方当事人应仔细审查补充协议的条款，确保没有遗漏或模糊之处，以避免未来可能出现的纠纷。
举例说明：假设甲乙双方签订了一份买卖合同（主协议），约定了货物的名称、数量和价格，但未约定货物的交付时间和方式。后来，双方通过签订补充协议明确了货物的交付时间和方式。这样，补充协议就完善了主协议的内容，使双方的权利和义务更加明确。
综上所述，“主协议之补充协议”指的就是对主协议进行补充和完善的协议。如果你在签订或履行主协议及补充协议过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。