当车主不认定损失时，您可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
收集并固定证据：
- 现场证据：在事故发生后，立即拍摄现场照片和视频，记录车辆损坏情况、事故现场环境等，这些证据对于后续确定损失范围至关重要。
- 维修记录：如果车辆已经进行了维修，务必保留好维修发票、维修清单以及更换的零部件等，这些都能作为证明损失实际发生的直接证据。
- 证人证言：如果有目击者，尽量获取他们的联系方式，以便在需要时提供证人证言。
与车主协商：
- 沟通协商：尝试与车主进行友好沟通，说明事故经过、损失情况以及您认为的责任划分，看是否能够达成一致意见。
- 书面协议：如果协商成功，务必签订书面协议，明确双方的责任、赔偿金额以及支付方式等，以避免后续纠纷。
寻求第三方评估：
- 专业评估机构：如果车主对损失有异议，您可以共同委托一家具有资质的第三方评估机构对车辆损失进行评估。评估报告将作为客观、公正的证据，有助于解决争议。
- 评估费用：评估费用通常由双方协商分担，或者根据事故责任比例分担。如果车主拒绝承担评估费用，您可以在后续的法律程序中主张由车主承担。
法律途径：
- 起诉车主：如果协商和第三方评估都无法解决问题，您可以考虑向法院提起诉讼，要求车主承担赔偿责任。在诉讼过程中，您需要提交上述收集的证据来支持您的主张。
- 保险理赔：如果您购买了车辆保险，并且事故属于保险责任范围，您还可以向保险公司申请理赔。保险公司将根据保险合同和事故情况来确定赔偿金额。
注意事项：
- 时效性：注意诉讼时效问题，根据《中华人民共和国民法典》的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。因此，您需要在诉讼时效期间内提起诉讼或采取其他法律措施。
- 保留证据原件：在处理事故过程中，务必保留好所有证据的原件，如照片、视频、维修发票等。这些证据在后续的法律程序中可能起到关键作用。
在处理此类纠纷时，建议您保持冷静和理性，通过合法途径来维护自己的权益。 如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供更详细的法律建议。