针对您提出的“主管药师犯罪后怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、刑事责任与法律条款
主管药师，作为执业药师的一种，若涉及刑事犯罪，将依据《中华人民共和国刑法》及相关法律法规进行定罪量刑。具体可能涉及的罪名包括但不限于：
生产、销售假药罪：若主管药师明知药品为假仍参与生产或销售，根据《中华人民共和国刑法》第一百四十一条，将根据情节轻重，面临三年以下有期徒刑至死刑的刑罚，并可能并处罚金或没收财产。
生产、销售劣药罪：若因主管药师的管理不善导致药品变质，并继续提供给患者使用，造成健康损害，根据《中华人民共和国刑法》第一百四十二条，可能面临三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；后果特别严重的，还可能面临十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处罚金或没收财产。
非法提供麻醉药品、精神药品罪：若主管药师违规为吸毒人员提供麻醉药品或精神药品，根据《中华人民共和国刑法》第三百五十五条，将面临三年以下有期徒刑至七年有期徒刑的刑罚，并可能并处罚金。
二、刑事诉讼程序与处理流程
当主管药师涉嫌刑事犯罪时，将按照以下流程进行处理：
立案侦查：公安机关或相关执法机构将立案调查，收集证据，以确定犯罪事实。
强制措施：根据需要，执法机关可能对犯罪嫌疑人采取拘留、逮捕等强制措施，以确保其不会逃避法律制裁。
审查起诉：检察机关将对案件进行全面审查，包括证据的充分性、犯罪的严重性等，以决定是否提起公诉。
审判：法院将组成合议庭，公开审理案件，并根据事实和法律作出判决。判决可能包括有期徒刑、罚金、没收财产等。
附带民事诉讼：如果犯罪行为给被害人造成了损失，被害人可以在刑事诉讼过程中提起附带民事诉讼，要求犯罪嫌疑人进行赔偿。
三、执业资格处理
除了面临刑事处罚外，主管药师的执业资格也将受到严重影响：
注销注册：根据《执业药师注册管理办法》的相关规定，受到刑事处罚的执业药师需办理注销注册手续，即失去继续从事执业药师工作的资格。
禁业限制：依据《药品管理法》的规定，因药品犯罪被判处刑罚的执业药师，将终身不得从事药品生产经营活动，也无法重新注册成为执业药师。
四、总结与建议
主管药师作为医疗行业的专业人士，应严格遵守法律法规和职业道德规范。违法行为不仅会导致个人面临严重的刑事和民事法律责任，还会对整个行业造成负面影响。因此，我建议主管药师在日常工作中加强法律意识，确保行为的合法性和合规性，以维护自身职业声誉和行业形象。同时，如果面临法律问题或疑虑，应及时咨询专业律师或相关机构，以获取准确的法律建议和帮助。