针对您提出的“村公章法人签字后别人盖章怎么处理”的问题，这涉及到村级公章的使用管理制度，以下是我根据相关规定和制度给出的详细解答：

首先，我们需要明确的是，村级公章是村级公共权力的象征，其使用必须严格遵守相关管理制度，以确保其合法性、严肃性和可靠性。在公章的使用过程中，通常需要经过村主要领导的同意并签字，这是公章使用的基本程序。

针对您的情况，如果法人（即村主要领导，如村党支部书记或村民委员会主任）已经签字同意，但实际盖章的是其他人，这需要根据具体情况来处理：

1. 如果盖章行为符合制度规定：

   • 如果法人签字后，因工作需要或特殊情况，由其他被授权的人员代为盖章，且这一行为在村级公章使用管理制度中有明确规定或经过法人特别授权，那么这种盖章行为是合法的。
   • 在这种情况下，应确保盖章行为有明确的记录，包括盖章时间、盖章内容、盖章人员等信息，以便后续查证。

2. 如果盖章行为不符合制度规定：

   • 如果法人签字后，未经授权或违反制度规定，由其他人擅自盖章，这种行为是违法的，可能给村集体带来损失或风险。
   • 在这种情况下，应立即停止盖章行为，并追查责任。如果已经造成了损失，应依法追究相关人员的责任。
   • 同时，应加强公章使用管理制度的宣传和执行力度，确保所有村干部和工作人员都了解并遵守相关规定。

3. 关于公章的保管和交接：

   • 公章应由专人负责保管，保管人因事离岗时，应由其他村干部或村工作人员临时代管，并确保公章的安全。
   • 公章的移交应办理手续，签移交证明，注明移交人、接交人、监交人、移交时间等信息，以确保公章的交接过程清晰、可追溯。

4. 加强公章使用管理的建议：

   • 建立健全公章使用审批、登记、备案制度，并纳入村民自治章程或村规民约之中。
   • 加强对公章保管人和使用审批人的培训和教育，提高他们的法律意识和责任意识。
   • 定期对公章的使用情况进行检查和审计，确保公章的使用符合制度规定和法律法规要求。

综上所述，对于“村公章法人签字后别人盖章怎么处理”的问题，关键在于判断盖章行为是否符合村级公章使用管理制度的规定。如果符合规定，则盖章行为合法；如果不符合规定，则应立即停止并追查责任。同时，应加强公章使用管理的制度建设和执行力度，确保公章的合法、严肃和可靠使用。