施工单位被法院查封时，农民工仍可通过以下途径主张工资权益，具体操作需结合查封性质与工资支付情况分情况处理：

1. 区分查封标的与工资支付责任主体

   • 若法院查封的是施工单位的非工资专用账户资金或其他财产（如设备、房产），但施工单位仍有流动资金或未被查封的资产，农民工可直接依据《保障农民工工资支付条例》第16条，要求施工单位通过未被查封的账户或资产优先支付工资。此时需注意保留劳动合同、考勤记录、工资欠条等证据，向施工单位书面催告并留存凭证。
     
   • 若查封的是工资专用账户资金，根据《保障农民工工资支付条例》第33条，除法律另有规定外，不得因支付为本项目提供劳动的农民工工资之外的原因被查封、冻结或者划拨。此时农民工可向法院提出执行异议，要求解除对工资专用账户的查封，并附上工资专用账户开户证明、工资发放明细等材料。

2. 向上游发包方主张“连带清偿责任”

   • 若施工单位因欠付工程款被查封，且发包方（建设单位或总承包单位）未按照合同约定支付工程款，根据《保障农民工工资支付条例》第30条，农民工可要求发包方以未结清的工程款为限先行垫付工资。此时需提供与施工单位的劳动关系证明、施工单位出具的欠薪证明，以及发包方与施工单位的工程款支付合同等材料，向发包方书面主张权利。
     
   • 若发包方拒绝垫付，农民工可同时起诉施工单位和发包方，要求二者承担连带清偿责任。法院审理中会重点审查发包方是否欠付工程款、欠付金额是否足以覆盖工资等事实。

3. 申请“劳动监察介入”或“法律援助”

   • 若施工单位已停业或负责人失联，农民工可向当地劳动保障监察部门投诉，由劳动监察部门立案调查并责令施工单位或发包方支付工资；若查封导致施工单位无法履行支付义务，劳动监察部门可协调发包方或政府应急周转金先行垫付。
     
   • 家庭困难的农民工可向当地法律援助机构申请免费法律援助，由律师协助准备起诉材料、参与诉讼或调解，降低维权成本。

关键提醒：农民工需优先通过书面催告、证据固定（如录音、录像、微信聊天记录）等方式留存维权痕迹，避免因口头主张难以举证而陷入被动。若查封涉及刑事犯罪（如施工单位恶意转移资产逃避债务），可向公安机关报案，追究相关责任人拒不支付劳动报酬罪的刑事责任。

如有具体案件细节（如查封原因、工资欠付金额、合同签订情况等），可进一步向我说明，我会结合实际情况提供更精准的维权方案。