关于“造成损失的，双方约定以甲方鉴定结果为准是否有效”的问题，结论是：该约定是否有效需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、约定有效的情形
双方自愿且意思表示真实：
- 如果双方当事人在平等、自愿的基础上，经过充分协商，明确约定以甲方的鉴定结果作为确定损失的依据，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么该约定是有效的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为的有效要件包括行为人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定、不违背公序良俗。
鉴定机构或鉴定人具备相应资质：
- 如果甲方指定的鉴定机构或鉴定人具备相应的鉴定资质和专业知识，能够客观、公正地进行鉴定，并出具合法有效的鉴定报告，那么该鉴定结果作为确定损失的依据是合理的。
- 实践操作：在实际操作中，为了确保鉴定结果的公正性和准确性，双方可以约定由具有相应资质的第三方鉴定机构进行鉴定，或者对鉴定过程进行监督。
二、约定可能无效或存在争议的情形
约定显失公平：
- 如果该约定明显对一方当事人不利，例如甲方指定的鉴定机构与甲方存在利益关系，可能导致鉴定结果偏向甲方，从而损害另一方的利益，那么该约定可能因显失公平而被认定为无效或可撤销。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，显失公平的民事法律行为，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
鉴定程序违法或鉴定结果不真实：
- 如果鉴定过程存在违法行为，如鉴定人未按照法定程序进行鉴定、鉴定报告内容不真实等，那么该鉴定结果不能作为确定损失的依据，双方约定的效力也会受到影响。
- 实践操作：在这种情况下，受损方可以要求重新鉴定或寻求其他法律途径来维护自己的权益。
约定违反法律或行政法规的强制性规定：
- 如果双方约定的内容违反了法律或行政法规的强制性规定，例如约定了非法鉴定机构进行鉴定，那么该约定是无效的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。
三、建议
在签订合同时明确约定：
- 双方在签订合同时，应明确约定损失的确定方式，包括鉴定机构的选择、鉴定程序的规范等，以避免后续争议。
选择具有资质的鉴定机构：
- 为了确保鉴定结果的公正性和准确性，双方应选择具有相应资质的第三方鉴定机构进行鉴定。
保留相关证据：
- 在鉴定过程中，双方应保留好相关证据，如鉴定报告、鉴定过程记录等，以备后续维权之需。
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