结论：卖5万发票但只开具3000金额的行为，很可能构成虚开发票，具体是否构成需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
- 虚开发票的定义与构成要件
根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条，虚开发票包括以下情形：
- 为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
- 让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票；
- 介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票。
关键点：发票金额与实际交易金额是否一致。若实际交易金额为5万，但开具的发票金额仅为3000，明显与实际经营业务不符，符合虚开发票的构成要件。
- 行为性质分析
- 主观方面：若行为人明知实际交易金额为5万，仍故意开具3000的发票，主观上具有虚开的故意；
- 客观方面：发票金额与实际交易金额不符，且可能伴随少缴税款、套取资金等目的，客观上损害了国家税收征管秩序。
结论：无论行为人是否从中获利，只要发票金额与实际交易不符，均可能构成虚开发票。
- 法律后果
- 行政责任：根据《发票管理办法》第三十七条，虚开发票的，由税务机关没收违法所得；虚开金额在1万元以下的，可以并处5万元以下的罚款；虚开金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
- 刑事责任：若虚开发票情节严重（如虚开税款数额较大或造成国家税款损失），可能构成《刑法》第二百零五条之一的“虚开发票罪”，处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金；情节特别严重的，处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
- 例外情形
若存在以下情形，可能不构成虚开发票：
- 实际交易金额确实为3000，但因操作失误或沟通错误导致开具金额错误，且能提供充分证据证明；
- 双方存在合法合理的商业安排（如分期付款、部分退款等），且能提供完整证据链。
提示：此类例外情形需严格举证，实践中认定难度较大。
建议：若您涉及此类问题，建议立即停止相关行为，并主动向税务机关说明情况。如有进一步疑问或需要法律帮助，可直接向我咨询，我将结合具体案情为您提供专业分析。