集体企业大部分员工不同意企业注销，这一行为本身并不直接构成违法，但企业注销需遵循法定程序，员工意见是重要考量因素之一。以下从不同角度详细分析：

一、企业注销的法定程序

企业注销，无论是集体企业还是其他类型的企业，都需要遵循《中华人民共和国公司法》（若集体企业参照公司制管理）或相关集体企业法规规定的程序。这些程序通常包括：

1. 清算程序：企业决定注销前，需成立清算组，对企业的财产、债权、债务进行全面清算。
2. 通知与公告：清算组需通知债权人，并在指定媒体上公告，确保债权人有机会申报债权。
3. 债务清偿：在清算过程中，需优先清偿企业的债务。
4. 注销登记：完成清算后，需向工商行政管理部门申请注销登记，经审核通过后，企业正式注销。

二、员工意见在注销过程中的作用

1. 集体企业特性：集体企业通常由员工集体所有或管理，因此员工的意见在企业决策中占有重要地位。虽然法律并未明确规定集体企业注销必须经全体员工同意，但员工的反对意见可能影响企业决策的合法性和合理性。
2. 民主决策程序：若集体企业章程或相关法规规定了民主决策程序（如职工代表大会或员工大会决议），则企业注销需遵循这些程序。在此情况下，大部分员工不同意注销可能构成注销的障碍。
3. 社会稳定与和谐：从社会稳定和和谐的角度出发，企业注销可能涉及员工安置、补偿等问题。若大部分员工不同意注销，企业需充分考虑员工利益，寻求妥善解决方案，以避免引发社会矛盾。

三、可能面临的法律后果

1. 若企业未遵循法定程序注销：可能面临工商行政管理部门等监管机构的处罚，如罚款、撤销注销登记等。
2. 若企业忽视员工意见导致纠纷：可能引发劳动争议或集体诉讼，企业需承担相应的法律责任，包括赔偿员工损失等。

四、建议与措施

1. 充分沟通：企业应与员工进行充分沟通，解释注销的原因、程序及员工安置方案等，争取员工的理解和支持。
2. 遵循民主决策程序：若集体企业章程或相关法规规定了民主决策程序，企业应严格遵循，确保注销决策的合法性和合理性。
3. 妥善安置员工：企业应制定合理的员工安置方案，包括经济补偿、职业培训、再就业帮助等，以减轻员工因企业注销而带来的负面影响。

总结来说，集体企业大部分员工不同意企业注销并不直接构成违法，但企业需遵循法定程序进行注销，并充分考虑员工意见和利益。若企业忽视员工意见或未遵循法定程序，可能面临法律后果和社会矛盾。因此，建议企业在注销前与员工进行充分沟通，并遵循相关法规和民主决策程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。