对方应出具一份书面凭证，明确记载运费垫付及尾款扣除事宜，以下为具体说明及示例：

1. 核心要点：为确保双方权益，对方应出具一份书面凭证（如收条、欠条或协议），明确记载你垫付的运费金额、尾款总额、扣除方式及时间等关键信息。

2. 具体内容建议：

   • 标题：可写为“运费垫付及尾款扣除凭证”或“收条（含运费垫付说明）”等。
   • 正文：
     • 双方身份信息：写明你（垫付方）和对方（收款方）的姓名或名称、身份证号或统一社会信用代码（如为个人或企业）。
     • 运费垫付情况：明确你垫付的运费金额、支付方式（如现金、银行转账等）及支付时间。
     • 尾款情况：写明尾款总额、支付期限及支付方式。
     • 扣除条款：明确运费将从尾款中扣除，并写明扣除后的尾款余额及支付时间。
     • 违约责任：可约定如对方未按约定支付尾款或扣除运费，应承担的违约责任（如支付违约金、赔偿损失等）。
     • 争议解决方式：约定如发生争议，双方应协商解决；协商不成的，可提交仲裁或诉讼解决。
   • 落款：由对方签字或盖章，并注明出具日期。

3. 示例：

运费垫付及尾款扣除凭证

兹有（你姓名/名称），身份证号/统一社会信用代码：（你的证件号码），于（支付日期）向（对方姓名/名称），身份证号/统一社会信用代码：（对方证件号码），垫付运费人民币（大写）______元整（￥______元），支付方式为（现金/银行转账等）。

双方约定，上述运费将从（合同名称或项目名称）的尾款中扣除。尾款总额为人民币（大写）______元整（￥______元），支付期限为（支付截止日期），支付方式为（银行转账/现金等）。扣除运费后，尾款余额为人民币（大写）______元整（￥______元），将于（余额支付日期）支付至（你银行账户信息或指定收款方式）。

如（对方姓名/名称）未按约定支付尾款或扣除运费，应承担违约责任，包括但不限于支付违约金、赔偿损失等。

如发生争议，双方应协商解决；协商不成的，可提交（仲裁机构名称）仲裁或向（法院名称）提起诉讼。

此凭证一式两份，双方各执一份，具有同等法律效力。

对方签字/盖章：__________________
出具日期：______年______月______日

提醒：在签署任何书面凭证前，请务必仔细阅读并理解其内容，确保所有条款均符合你的意愿和实际情况。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。