机关事业单位在收到干部辞职申请后，应依法依规、妥善应对，核心要点包括：依法处理辞职程序、做好工作交接与档案转移、关注特殊岗位或涉密人员的后续管理、妥善处理工资福利及社保关系、预防法律风险。 以下分情况详细说明：

1. 依法处理辞职程序

• 核实辞职申请的合法性：首先需确认干部提交的辞职申请是否符合《公务员法》《事业单位人事管理条例》等法律法规的规定。例如，公务员需提前30日以书面形式提出申请，且在特定情形下（如未满最低服务年限、重要公务未处理完毕等）可能不得辞职。
• 履行审批程序：根据干部管理权限，及时将辞职申请报送上级主管部门或组织人事部门审批。审批过程中，应确保程序公开透明，避免因程序瑕疵引发纠纷。
• 出具书面答复：无论是否批准辞职，均应向干部出具书面答复，明确告知结果及依据。若不批准，需说明理由；若批准，则应明确离职日期及相关后续事项。

2. 做好工作交接与档案转移

• 组织工作交接：要求辞职干部在离职前完成工作交接，包括文件资料、财务账目、项目进展等，确保工作连续性。必要时，可安排专人监督交接过程。
• 转移人事档案：根据干部管理权限，及时将其人事档案转移至新单位或人才交流机构。转移过程中需严格遵守档案管理制度，确保档案完整、安全。
• 出具离职证明：为辞职干部出具离职证明，明确其在职期间的工作表现、离职原因等，为其后续就业提供便利。

3. 关注特殊岗位或涉密人员的后续管理

• 涉密岗位人员：若辞职干部曾从事涉密工作，需按照保密法律法规的要求，与其签订保密协议或竞业限制协议，明确其在离职后一定期限内不得泄露国家秘密或商业秘密。
• 特殊岗位人员：对于担任领导职务或掌握重要资源的人员，需关注其离职后的去向，防止利益冲突或不当竞争。必要时，可要求其承诺在一定期限内不从事与原单位业务相关的活动。

4. 妥善处理工资福利及社保关系

• 结算工资福利：根据干部在职期间的工作表现及考勤记录，及时结算其应得的工资、奖金、津贴等福利待遇。
• 转移社保关系：协助辞职干部办理社会保险关系的转移手续，确保其社保权益不受影响。对于符合条件的干部，可指导其申请失业保险或享受其他社会保障待遇。

5. 预防法律风险

• 完善内部管理制度：建立健全辞职管理制度，明确辞职申请、审批、交接、档案转移等环节的具体流程和要求，减少因管理不善引发的法律风险。
• 加强法律宣传教育：定期组织干部学习相关法律法规和政策文件，提高其法律意识和合规意识，避免因无知或疏忽而触犯法律。
• 建立纠纷应对机制：对于可能出现的辞职纠纷，应提前制定应对预案，明确责任分工和处置流程。一旦发生纠纷，应及时介入调解或依法处理，防止事态扩大。

总结：机关事业单位在收到干部辞职申请后，应依法依规、妥善应对，确保辞职程序合法合规、工作交接顺畅有序、档案转移安全可靠、工资福利结算清晰明了、法律风险有效预防。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，请直接向我咨询。