企业法定代表人也是股东的情况下，是可以申请劳动仲裁的。以下从不同角度为你详细分析：

法律关系角度

企业法定代表人与企业之间通常存在劳动关系（当然，也存在例外情况，比如法定代表人只是挂名，并不实际参与企业经营管理，与企业不存在实际劳动关系）。当法定代表人作为劳动者，与企业之间就劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利等事项产生争议时，根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的规定，这些争议属于劳动仲裁的受案范围。股东身份并不影响其作为劳动者申请劳动仲裁的权利。例如，某公司的法定代表人同时也是股东，公司长期拖欠其工资，此时该法定代表人就可以以劳动者的身份向劳动仲裁机构申请仲裁，要求公司支付拖欠的工资。

身份独立性角度

法定代表人和股东是两个不同的身份，虽然一个人可以同时具备这两个身份，但它们在法律上具有相对独立性。股东主要享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利，而法定代表人则是代表企业行使职权的人员。在劳动争议中，关注的是劳动者与企业之间的劳动关系，而不是股东与企业之间的股权关系。所以，即使法定代表人同时也是股东，只要其与企业之间存在劳动关系且发生了劳动争议，就可以申请劳动仲裁。

实际操作角度

在实际操作中，企业法定代表人申请劳动仲裁可能会面临一些特殊情况。比如，企业可能会以法定代表人的特殊身份为由，拒绝承认其劳动者的地位，或者对仲裁申请提出各种异议。但这些都不能成为阻碍法定代表人申请劳动仲裁的理由。只要法定代表人能够提供证据证明其与企业之间存在劳动关系，如劳动合同、工资支付记录、工作证等，劳动仲裁机构就会依法受理其申请。

建议：如果企业法定代表人也是股东，且与企业发生了劳动争议，建议及时收集相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明自己与企业之间存在劳动关系。然后，按照劳动仲裁的程序，向有管辖权的劳动仲裁机构提交仲裁申请，依法维护自己的合法权益。如果对仲裁结果不满意，还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。

如果你还有其他关于劳动仲裁或公司法务方面的问题，欢迎直接向我咨询。