发票抵扣后合同未盖章，合同效力需分情况讨论，不能一概而论其有效或无效。具体分析如下：

1. 合同生效的一般原则
   根据《民法典》第四百九十条，合同成立需双方意思表示一致，通常以签字或盖章为形式要件。若合同明确约定“签字并盖章后生效”，则未盖章可能导致合同未成立；若未作此约定，双方已实际履行主要义务（如一方已开具发票并抵扣，另一方接受服务或货物），则合同可能因实际履行而生效。

2. 发票抵扣的证明力
   发票抵扣行为可视为双方对合同内容的实际履行，尤其在税务层面确认了交易的真实性。若一方以未盖章为由主张合同无效，但另一方能证明已实际履行主要义务（如交付货物、提供服务），法院可能依据《民法典》第四百九十条第二款，认定合同成立并生效。

3. 未盖章的潜在风险

   • 合同形式瑕疵：若合同未盖章且无其他履行行为，可能因形式不完备被认定为未成立，导致权利义务无法明确。
     
   • 举证责任：主张合同有效的一方需承担举证责任，证明双方存在合意及实际履行事实，否则可能承担不利后果。
     
   • 税务合规风险：发票抵扣需以真实交易为基础，若合同未成立，可能引发税务机关对虚开发票的核查，甚至涉及行政处罚。

建议：

• 若合同未盖章但已实际履行，建议补充盖章或通过书面协议确认合同效力，避免争议。
  
• 若对方以未盖章为由拒绝履行义务，可收集履行证据（如送货单、对账单、沟通记录等），通过法律途径主张权利。
  
• 涉及重大交易时，务必在合同中明确生效条件，并确保形式要件完备，以降低法律风险。

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