当合同条款与招标文件实质性内容不一致时，违反了《中华人民共和国招标投标法实施条例》第七十五条的相关规定。具体来说：
法规内容
《中华人民共和国招标投标法实施条例》第七十五条规定：“招标人和中标人不按照招标文件和中标人的投标文件订立合同，合同的主要条款与招标文件、中标人的投标文件的内容不一致，或者招标人、中标人订立背离合同实质性内容的协议的，由有关行政监督部门责令改正，可以处中标项目金额5‰以上10‰以下的罚款。”
解读与分析
违规行为：该条款明确指出了招标人和中标人在订立合同时，必须严格按照招标文件和中标人的投标文件来进行，不得随意更改实质性内容。如果合同的主要条款与招标文件、中标文件的内容不一致，或者双方订立了背离合同实质性内容的协议，都构成了违规行为。
法律责任：对于上述违规行为，有关行政监督部门将责令改正，并可以根据违规的严重程度，对招标人或中标人处以中标项目金额5‰至10‰的罚款。这一规定既体现了对违规行为的惩罚性，也体现了对招标投标活动公平、公正原则的维护。
实际应用
在招标投标活动中，招标文件是招标人向投标人发出的要约邀请，而投标文件则是投标人向招标人发出的要约。当招标人确定中标人后，双方应当按照招标文件和中标文件的内容订立合同。如果合同内容与招标文件、中标文件不一致，不仅可能损害双方当事人的合法权益，还可能破坏招标投标活动的公平性和公正性。
因此，在订立合同时，双方应当仔细核对合同条款与招标文件、中标文件的内容是否一致，确保合同的合法性和有效性。如果发现不一致的情况，应当及时沟通并协商解决，以避免可能的法律风险和纠纷。
希望这个解答能够帮助你更好地理解相关法律规定，并在实际工作中加以应用。如果你还有其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。