结论：在国内企业合作共同出资设立新企业的情境下，合同书可以命名为合资协议、合作协议或合股协议，但具体选择需根据合作性质、目的及各方权利义务来定。以下是对这三种协议类型的详细分析：
合资协议：
- 定义与适用：合资协议通常用于描述两个或两个以上的企业为了共同开展某项业务或项目，按照约定共同出资、共同经营、共享收益、共担风险而订立的协议。它强调的是“共同出资设立新企业”这一行为，且新企业通常具有独立的法人资格。
- 内容要点：合资协议会详细规定各方的出资额、出资方式、股权比例、公司治理结构、利润分配、亏损承担、决策机制、解散与清算等关键条款。
- 适用场景：当合作各方希望共同设立一个新企业，并希望该企业具有独立的法律地位和运营能力时，选择合资协议是合适的。
合作协议：
- 定义与适用：合作协议则更侧重于描述合作各方在某一特定项目或业务上的合作关系，不一定涉及共同出资设立新企业。它可以是松散型的合作，也可以是紧密型的合作，具体取决于协议内容。
- 内容要点：合作协议可能包括合作目标、合作范围、合作方式、各方权利义务、保密条款、违约责任等。如果合作涉及共同出资设立新企业，则合作协议中也会包含与出资、股权、治理等相关的条款，但可能不如合资协议详细。
- 适用场景：当合作各方希望在某一特定领域或项目上进行合作，但不一定需要共同出资设立新企业时，选择合作协议更为合适。如果合作确实涉及共同出资设立新企业，但各方更关注合作的具体业务而非新企业的法律地位和运营，合作协议也是一个可行的选择。
合股协议：
- 定义与适用：合股协议在实务中并不常见，它可能更多地用于描述一种股权合作或股份合作的安排。在某些情况下，合股协议可能被视为合资协议的一种特殊形式，即各方通过合股的方式共同出资设立新企业。
- 内容要点：合股协议会关注股权的分配、转让、增减资等股权相关事项，以及由此产生的权利义务关系。
- 适用场景：如果合作各方更关注股权的分配和变动，以及由此产生的治理和决策机制，那么合股协议可能是一个更合适的选择。然而，在大多数情况下，合资协议已经足够涵盖这些内容，因此合股协议的使用相对较少。
建议：
- 在选择协议类型时，应首先明确合作的目的、性质和各方的主要权利义务。
- 如果合作涉及共同出资设立新企业，且希望新企业具有独立的法律地位和运营能力，建议选择合资协议。
- 如果合作更侧重于特定项目或业务上的合作，而不一定需要共同出资设立新企业，或者虽然涉及共同出资但更关注合作的具体业务而非新企业的法律地位和运营，那么合作协议可能更为合适。
- 合股协议在实务中较少使用，但如果合作各方对股权的分配和变动有特别关注，且合资协议无法完全满足需求时，可以考虑使用合股协议或将其相关条款纳入合资协议中。
在实际操作中，无论选择哪种协议类型，都应确保协议内容合法、合规、明确、具体，并充分考虑各方利益平衡和风险防控。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。