判决要求迁出占用房屋，这一执行请求确实受到两年申请执行时效的限制。以下是对这一问题的详细分析：

一、申请执行时效的法律规定

根据《中华人民共和国民事诉讼法》（以下简称《民诉法》）的相关规定，申请执行的期间为二年。这一期间从法律文书规定履行期间的最后一日起计算；法律文书规定分期履行的，从规定的每次履行期间的最后一日起计算；法律文书未规定履行期间的，从法律文书生效之日起计算。因此，在判决要求迁出占用房屋的情况下，如果义务人未在规定期限内履行迁出义务，权利人需要在判决生效后的两年内向法院申请强制执行。

二、超过申请执行时效的后果

1. 法院不再强制执行：如果权利人未在两年内申请执行，且没有中止、中断等法定事由，那么法院将不再强制执行该判决。这意味着，义务人可能因此逃避了迁出房屋的义务。
2. 丧失胜诉权：超过申请执行时效后，权利人虽然仍然可以向法院提起诉讼或申请执行，但法院将不再支持其请求。这相当于权利人丧失了通过法律手段强制义务人迁出房屋的权利。

三、特殊情况下的处理

1. 中止、中断事由：在申请执行时效期间内，如果发生法定中止、中断事由（如权利人向义务人提出履行请求、义务人同意履行义务等），那么申请执行时效将重新计算。这意味着，在这些情况下，权利人仍然有可能在超过原定期限后申请执行。
2. 义务人自愿履行：即使超过申请执行时效，如果义务人自愿履行迁出房屋的义务，那么权利人仍然可以接受并享受该履行结果。这种情况下，法院不会干预义务人的自愿履行行为。

四、法律建议

1. 及时申请执行：为了确保判决得到有效执行，权利人应在判决生效后尽快向法院申请强制执行，避免超过申请执行时效。
2. 关注时效中断事由：在申请执行时效期间内，权利人应密切关注可能发生的中止、中断事由，并及时采取相应措施以保护自己的权益。
3. 咨询专业律师：如果权利人对申请执行时效或相关法律程序有疑问，建议咨询专业律师以获取更详细的法律建议和指导。

综上所述，判决要求迁出占用房屋确实受到两年申请执行时效的限制。权利人应在规定期限内及时申请执行，以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。