在摩托车与电动车发生碰撞的交通事故中，事故认定书出具后，赔偿金的支付流程一般如下：

一、明确责任划分

首先，需依据事故认定书确定双方的责任比例。这是赔偿金支付的基础，因为赔偿金的分担通常与责任比例直接相关。例如，若摩托车方被认定为全责，则其需承担全部赔偿金；若双方均有责任，则按责任比例分担。

二、计算赔偿金数额

赔偿金数额的计算涉及多个方面，包括但不限于：

1. 医疗费用：包括因事故导致的医疗费、住院费、药费等。
2. 误工费：因事故导致的无法工作而减少的收入。
3. 护理费：若伤者需要护理，则产生的护理费用。
4. 营养费：根据伤者情况，可能需要额外补充营养的费用。
5. 残疾赔偿金：若事故导致伤者残疾，则需支付残疾赔偿金。
6. 财产损失：如车辆损坏、随身物品丢失等。

计算公式示例（以误工费为例）： 误工费 = 误工时间 × 每日收入 其中，误工时间根据医疗机构出具的证明确定，每日收入则根据伤者的实际收入情况确定。

三、协商赔偿事宜

在明确责任划分和赔偿金数额后，双方应首先尝试通过协商解决赔偿事宜。这可以节省时间和成本，并有助于维护双方的关系。协商时，应就赔偿金的数额、支付方式、支付时间等达成一致意见，并签订书面协议。

四、支付赔偿金

若协商成功，则按照协议约定的方式和时间支付赔偿金。支付方式可以是现金、银行转账等。支付完成后，双方应保留好相关凭证，以备不时之需。

五、若协商不成，则通过法律途径解决

若双方无法就赔偿事宜达成一致意见，则可以通过法律途径解决。这通常包括以下步骤：

1. 提起诉讼：向法院提起民事诉讼，要求对方承担赔偿责任。
2. 法院审理：法院将依法审理案件，并作出判决。
3. 执行判决：若判决对方承担赔偿责任，则对方需按照判决内容支付赔偿金。若对方拒不支付，则可申请法院强制执行。

六、特殊情况处理

1. 若一方对事故认定书有异议：可在收到事故认定书之日起三日内向上一级公安机关交通管理部门提出书面复核申请。复核申请应当载明复核请求及其理由和主要证据。
2. 若涉及保险理赔：则需及时向保险公司报案，并按照保险公司的要求提供相关材料和证明。保险公司将根据保险合同的约定进行理赔。

总结与建议：在摩托车与电动车发生碰撞的交通事故中，赔偿金的支付流程涉及多个环节。为确保自身权益得到保障，建议双方在事故发生后及时报警、保留好相关证据、明确责任划分、计算赔偿金数额，并尝试通过协商解决赔偿事宜。若协商不成，则应及时通过法律途径解决。在整个过程中，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。