结论前置：小区以前是部队的，现在新的物业公司开始收停车费是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及土地权属、物业服务合同约定以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

一、土地权属角度

1. 若小区土地已转为民用并划归地方管理：

   • 在这种情况下，小区的土地使用权已不属于部队，而是归地方所有或由小区业主共有。新的物业公司若经过合法程序入驻小区，并与业主或业主委员会签订了物业服务合同，且合同中明确约定了停车费的收取标准和方式，那么物业公司收取停车费是合法的。

2. 若小区土地仍属于部队或未明确划归地方：

   • 如果小区土地仍属于部队所有，或者虽然部队已撤离但土地权属尚未明确划归地方，那么物业公司收取停车费可能涉及土地使用权的争议。在这种情况下，物业公司未经部队或相关土地管理部门同意擅自收取停车费，可能构成违法。

二、物业服务合同角度

• 合同约定：物业公司收取停车费是否合法，还取决于其与业主或业主委员会签订的物业服务合同中是否有相关约定。如果合同中明确规定了停车费的收取标准和方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么物业公司收取停车费是合法的。
• 合同效力：如果物业服务合同未经业主或业主委员会同意，或者合同内容违反法律法规的强制性规定，那么该合同可能无效或部分无效。在这种情况下，物业公司依据无效合同收取停车费，可能构成违法。

三、相关法律法规角度

• 《物业管理条例》：该条例规定了物业服务企业的权利和义务，包括收取物业服务费、停车费等。但物业公司收取停车费必须遵循合法、合理、公开的原则，且不得损害业主的合法权益。
• 《民法典》：关于物业服务合同的规定，也强调了合同双方的平等、自愿、公平原则。物业公司收取停车费必须基于合法的物业服务合同，且合同内容不得违反法律法规的强制性规定。

四、实际操作建议

1. 核实土地权属：首先，需要核实小区土地的权属情况，确定土地是否已转为民用并划归地方管理。
2. 审查物业服务合同：其次，需要审查物业公司与业主或业主委员会签订的物业服务合同，确认合同中是否有关于停车费收取的约定。
3. 咨询相关部门：如果对土地权属或物业服务合同有疑问，可以咨询当地土地管理部门或房管部门，获取更权威的信息。
4. 依法维权：如果认为物业公司收取停车费不合法，业主或业主委员会可以依法向相关部门投诉或提起诉讼，维护自身合法权益。

总结：小区以前是部队的，现在新的物业公司开始收停车费是否合法，需根据土地权属、物业服务合同约定以及相关法律法规的规定来判断。如有疑问或争议，建议咨询专业律师或相关部门以获取更准确的法律意见。您若有进一步的法律问题，可以直接向我咨询。