年底考核时，休年假通常不应被扣分，但具体是否扣分需依据公司规章制度及劳动合同的约定来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、年假的法律性质
年假是劳动者依法享有的一项休息休假权利，根据《职工带薪年休假条例》的规定，职工在连续工作满一定年限后，有权享受带薪年休假。这是国家为了保障劳动者的休息权而设立的制度，具有强制性，用人单位应当予以保障。
二、年假与年底考核的关系
年假的独立性：年假是劳动者的一项独立权利，其享受与否通常不应与年底考核直接挂钩。年底考核主要是对劳动者一年来工作表现、工作成果等方面的评价，而年假则是劳动者在满足一定条件后依法享有的休息时间。
公司规章制度：虽然年假具有强制性，但具体如何安排年假（如年假的申请、审批、休假时间等）可能因公司而异。一些公司可能会在规章制度中规定，年假的休假情况会影响年底考核的某些方面（如出勤率、工作态度等），但这种规定必须合法合理，且不得违反国家法律法规的强制性规定。
劳动合同约定：劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了年假的休假情况与年底考核的关系，且该约定不违反国家法律法规的强制性规定，那么双方应当按照劳动合同的约定执行。
三、可能的情况分析
公司规章制度或劳动合同无相关规定：在这种情况下，年假的休假情况通常不应成为年底考核的扣分项。劳动者有权依法享受年假，且年假的休假不应影响其年底考核的结果。
公司规章制度或劳动合同有相关规定，但规定不合理或违法：如果公司规章制度或劳动合同中关于年假与年底考核的规定不合理（如无故扣分、降低绩效等）或违反国家法律法规的强制性规定（如剥夺劳动者年假权利等），那么这些规定是无效的。劳动者有权拒绝执行，并可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
公司规章制度或劳动合同有合理规定：如果公司规章制度或劳动合同中明确规定了年假的休假情况会影响年底考核的某些方面，且该规定合法合理（如将年假休假情况作为出勤率的一部分进行考核等），那么劳动者应当遵守该规定。但即使在这种情况下，公司也不得无故扣分或降低劳动者的绩效，必须确保考核的公正性和合理性。
四、建议与提醒
了解公司规章制度和劳动合同：劳动者在入职前或休假前应当仔细阅读公司规章制度和劳动合同中关于年假和年底考核的相关规定，确保自己的权益不受侵害。
保留相关证据：如果劳动者认为公司规章制度或劳动合同中关于年假与年底考核的规定不合理或违法，应当保留相关证据（如规章制度文本、劳动合同文本、休假申请记录等），以便在需要时维护自己的权益。
及时沟通协商：如果劳动者对年假的休假情况或年底考核结果有异议，应当及时与公司进行沟通协商，寻求合理的解决方案。
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