施工合同确实通常由协议书、通用条款和专用条款三部分组成，但这并不意味着中标通知书和图纸就不属于施工合同的组成部分，它们在不同情境和合同结构下，可能以不同形式被纳入或关联到施工合同中。以下是对这一问题的详细解释：
施工合同的基本构成：
- 协议书：是施工合同的首要部分，通常包含了合同双方的基本信息、工程概况、合同价款、工期等核心条款，是合同双方就工程实施达成的主要共识。
- 通用条款：是施工合同中具有通用性的条款，规定了合同双方在工程实施过程中应遵循的基本规则和原则，如质量标准、付款方式、变更处理、违约责任等。
- 专用条款：是针对具体工程项目而制定的特殊条款，用于对通用条款进行补充、修改或细化，以适应特定工程项目的需求。
中标通知书与图纸在施工合同中的地位：
- 中标通知书：在招投标过程中，中标通知书是招标人向中标人发出的，表明其中标并愿意与其签订合同的书面通知。虽然中标通知书本身不是施工合同的直接组成部分，但它通常是施工合同签订的前提和依据。在合同签订后，中标通知书中的关键信息（如中标价、工期等）通常会被纳入协议书或专用条款中。
- 图纸：图纸是施工合同的重要组成部分，它详细描述了工程的设计要求、结构形式、尺寸规格等，是施工人员进行施工的依据。在施工合同中，图纸通常作为附件或参考文件存在，与协议书、通用条款和专用条款共同构成完整的合同文件。
不同合同结构下的处理方式：
- 在一些标准的施工合同范本中，如《建设工程施工合同（示范文本）》（GF-2017-0201），合同文件通常包括合同协议书、通用合同条款、专用合同条款、技术标准和要求、图纸以及已标价工程量清单或预算书等。在这种结构下，图纸明确被列为合同文件的组成部分。
- 在其他情况下，如果合同双方选择使用非标准合同文本或自定义合同结构，他们可能会根据具体需求将中标通知书和图纸以不同形式纳入合同中。例如，中标通知书的关键信息可能被直接写入协议书或专用条款中，而图纸则可能作为附件或单独的文件与合同一并签署。
建议：在实际操作中，为了确保施工合同的完整性和准确性，合同双方应明确约定合同文件的组成和顺序，并将所有相关文件（包括中标通知书、图纸等）作为合同的一部分进行妥善保管和归档。如果您在施工合同方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。