使用权人不同意本身不犯法，但需根据具体情形判断后续法律后果及应对方式。以下从不同角度进行分析：
收回行为的合法性基础
若政府收回国有滩涂使用权并转为海域使用权的行为具有合法依据（如《海域使用管理法》第16条规定的“因公共利益或国家安全需要”），且履行了法定程序（如听证、补偿安置等），则使用权人不同意不影响收回行为的合法性。此时使用权人可通过行政复议或行政诉讼主张权利，但拒绝配合可能面临强制执行（如《行政强制法》第2条）。
使用权人的权利救济途径
若使用权人认为收回行为违法（如未补偿、程序瑕疵），其不同意是行使抗辩权的表现，不构成违法。但需注意：
- 补偿争议：根据《民法典》第243条，征收滩涂应给予公平补偿。若对补偿标准有异议，可申请协调、裁决或提起民事诉讼；
- 程序违法：若收回行为未履行法定程序（如未公告、未听证），可依据《行政诉讼法》第12条提起行政诉讼，请求撤销收回决定。
- 拒绝配合的法律风险
若收回行为合法，使用权人无正当理由拒绝交还土地，可能构成妨碍公务（如《刑法》第277条，但需以暴力、威胁方法阻碍国家机关工作人员依法执行职务为前提）或违反《土地管理法》第80条（拒不交出土地的，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令交还土地，处以罚款）。但单纯“不同意”未实施阻碍行为的，不构成违法。
建议：
- 若对收回行为合法性存疑，可要求政府出具书面依据并审查其程序合规性；
- 若认为补偿不合理，可委托评估机构对滩涂价值进行鉴定，作为协商或诉讼依据；
- 避免采取过激行为（如阻挠施工），否则可能承担行政或刑事责任。
如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。