农民组织修建的水源地被煤矿占用，赔偿问题需根据具体情况确定，一般涉及土地补偿、地上附着物补偿、停产停业损失补偿等多个方面。以下从不同角度进行详细分析：
一、赔偿主体与责任认定
- 煤矿企业责任：煤矿作为占用方，若未经合法程序占用农民组织修建的水源地，构成侵权或违法占用，应承担赔偿责任。赔偿主体为煤矿企业或其实际控制人。
- 政府责任：若煤矿占用行为经政府批准（如征收、征用），但政府未依法履行补偿义务或补偿标准不合法，政府可能成为共同赔偿主体或承担补充责任。
二、赔偿范围与标准
土地补偿：
- 土地使用权损失：若水源地占用涉及土地使用权（如集体建设用地、承包地），需按《土地管理法》及地方实施条例补偿土地价值。补偿标准通常参考当地土地征收补偿标准，包括土地补偿费、安置补助费等。
- 土地复垦费用：若占用导致土地破坏，煤矿需承担复垦费用或支付土地复垦费。
地上附着物补偿：
- 水源设施损失：包括水井、蓄水池、管道等直接用于水源地的设施，需按实际价值或重置成本补偿。
- 其他附着物：如房屋、树木等，按当地征收补偿标准赔偿。
停产停业损失：
- 若水源地被占用导致农民组织无法继续使用（如灌溉、饮水等），需赔偿因停产停业造成的直接损失（如农作物减产、饮水成本增加等）。
- 赔偿期限通常为占用期间，若占用导致长期无法恢复使用，需考虑长期损失。
其他损失：
- 环境损害赔偿：若占用导致水源污染或生态破坏，需按《民法典》侵权责任编或《环境保护法》赔偿环境修复费用及间接损失。
- 维权成本：包括律师费、诉讼费、鉴定费等合理支出，可要求煤矿承担。
三、赔偿程序与途径
- 协商解决：农民组织可与煤矿直接协商赔偿金额及方式，达成书面协议后履行。
- 行政调解：向当地政府或自然资源部门申请调解，由政府介入协调赔偿事宜。
- 仲裁或诉讼：若协商或调解无果，可向仲裁机构申请仲裁或向法院提起民事诉讼，要求煤矿承担赔偿责任。
四、注意事项
- 证据收集：农民组织需保留水源地建设、使用、占用等相关证据（如合同、照片、视频、鉴定报告等），以证明损失范围及金额。
- 补偿标准合法性：若占用行为经政府批准，需审查补偿标准是否符合《土地管理法》及地方规定，避免低价补偿。
- 及时主张权利：赔偿请求需在法定时效内提出（通常为3年），逾期可能丧失胜诉权。
建议：农民组织在处理此类问题时，可委托专业律师介入，通过法律途径维护权益。如有具体问题，可直接向我咨询。