结论前置：护理不良事件超时上报扣1000元是否合理，不能一概而论，需结合具体规定、合同条款及事件性质等多方面因素综合判断。以下从不同角度进行分析：
依据医院内部规定或合同条款判断
- 若规定或合同明确：如果医院内部有明确规定或护理人员的劳动合同中明确约定了护理不良事件的上报时限及超时上报的处罚措施，且该规定或条款不违反法律法规的强制性规定，那么医院按照规定或合同对超时上报的护理人员进行罚款，从合同法的角度来看，是合理的。但罚款金额需合理，不能过分高于实际损失或违反相关法律法规对罚款上限的规定。
- 若规定或合同未明确：如果医院内部规定或劳动合同中未明确规定护理不良事件的上报时限及超时上报的处罚措施，那么医院单方面对超时上报的护理人员进行罚款，可能缺乏法律依据，此时罚款行为可能不合理。
考虑事件性质与后果
- 轻微不良事件：如果护理不良事件性质轻微，未对患者造成明显损害或影响，且超时上报并未导致事件恶化或扩大，那么对护理人员处以1000元的罚款可能显得过于严厉，不太合理。
- 严重不良事件：如果护理不良事件性质严重，对患者造成了明显损害或影响，且超时上报可能加剧了事件的恶化或扩大，那么医院对护理人员进行一定的处罚，包括罚款，可能是合理的，但罚款金额仍需根据具体情况和医院规定来判断。
法律法规的考量
- 罚款的合法性：根据相关法律法规，医院作为事业单位或非营利性机构，其罚款行为需受到严格限制。除非法律法规明确授权医院可以对特定行为进行罚款，否则医院不得随意对员工进行罚款。因此，在判断罚款是否合理时，需考虑医院是否有权进行罚款。
- 罚款金额的合理性：即使医院有权进行罚款，罚款金额也需合理。根据《行政处罚法》（虽主要针对行政机关，但其中的罚款原则可作参考）等相关法律法规，罚款金额应与违法行为的事实、性质、情节以及社会危害程度相当。因此，1000元的罚款是否合理，需结合具体事件性质、后果及医院规定来判断。
建议：
- 对于护理人员而言，应严格遵守医院内部规定和劳动合同约定，及时上报护理不良事件，避免不必要的罚款和纠纷。
- 对于医院而言，应制定明确、合理的上报时限和处罚措施，并在劳动合同或内部规定中明确约定，以确保罚款行为的合法性和合理性。
- 若发生护理不良事件超时上报被罚款的情况，护理人员可先与医院沟通协商，了解罚款依据和金额合理性；若协商无果，可寻求法律援助或向相关部门投诉举报。
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